193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3484 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  100 
 
 		 297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  90.91 
 
 		 297 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  82.37 
 
 		 297 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  80.81 
 
 		 301 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  80.13 
 
 		 297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  80.68 
 
 		 297 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  76.27 
 
 		 297 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  56.99 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  54.31 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  53.99 
 
 		 302 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  50.18 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  46.6 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  47.99 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  47.99 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  47.84 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  48.93 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  48.41 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  48.41 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  50 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  50 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  43.84 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  44.64 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  44.68 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  40.79 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  43.26 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  35.56 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.58 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.38 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.38 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  28.19 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.2 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.67 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.73 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.68 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.68 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  27.31 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.45 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.27 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.19 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.97 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  30.28 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.56 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  32.32 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  32.32 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.71 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.21 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  23.44 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  31.19 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  27 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.42 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.03 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.76 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.88 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.31 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  23.95 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  22.34 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.66 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.66 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.66 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  23.53 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  24.81 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  23.17 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  28.09 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  28.09 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.72 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  28.89 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  30.51 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  24.62 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  23.32 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>