130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2796 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2796  permease  100 
 
 		 368 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  65.16 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  60.78 
 
 		 343 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  59.94 
 
 		 350 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  62.08 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  46.37 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  52.51 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  49.65 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  31.97 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  35.99 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  33.84 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  37.13 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.8 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.8 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  33.46 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  34.1 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  36.18 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  33.46 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  33.46 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  38.15 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  33.46 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  33.08 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  33.08 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.3 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  37.41 
 
 		 298 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  37.41 
 
 		 298 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  29.88 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  29.93 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  34.36 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.93 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  30.6 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.79 
 
 		 524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.54 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  31.33 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  28.66 
 
 		 350 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  28.87 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.01 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.33 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  31.97 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  39.1 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  31.8 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  40.48 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  25.78 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  28.1 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  25.44 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  33.56 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  41.74 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  43 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  29.73 
 
 		 620 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  23.39 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  27.08 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  25.55 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  25.41 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  25.23 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.55 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.57 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.81 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.12 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.6 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  23.88 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  24.2 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.08 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  22.88 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  21.03 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  26.19 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  31.9 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  26.92 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  27.22 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  26.19 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  21.99 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.63 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  28.96 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  29.41 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  40.24 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  30.52 
 
 		 451 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  27.46 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  39.02 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  25 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  28.35 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  25 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  30.17 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  28.57 
 
 		 474 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.55 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.73 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  25 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  33.05 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  28.41 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  32.58 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  37.8 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  29.01 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  24.19 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  28.24 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  29.01 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>