More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2501 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2390  hypothetical protein  64.97 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0353  hypothetical protein  54.03 
 
 		 336 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.01 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.36 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.89 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.65 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  29 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  33.22 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.22 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  31.35 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30.91 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  31.8 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  31.8 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.2 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  30.11 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  29.41 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  34.27 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  31.44 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  27.33 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  32.11 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  29.17 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  31.73 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  32.17 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  31.96 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  29.37 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  34.26 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  28.25 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  30.98 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  27.81 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  26.52 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  31.35 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  31.87 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  34.18 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  32.54 
 
 		 327 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  28.16 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  31.33 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  31.27 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  31.4 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  31.62 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  30.69 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  33.46 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.13 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  31.15 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  29.53 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  31.56 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  29.63 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  30.33 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  31.93 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  31.03 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  33.86 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  30.41 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  30.69 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  29.53 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  30.3 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  32.04 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  29.41 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  28.2 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  30.15 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2450  hypothetical protein  33.21 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5474  extra-cytoplasmic solute receptor  30 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  29.49 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  28.65 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  27.83 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0432  hypothetical protein  32.55 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.09 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  32.01 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  29.22 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  29.93 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  31.05 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  31.87 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  29.92 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  29.92 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  28.71 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  29.34 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  32.55 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  28.71 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  27.81 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.17 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  29.82 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  27.44 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  32.04 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  26.52 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3609  hypothetical protein  34.26 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  0.0172311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  31.93 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  31.18 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  29 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  30.92 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  28.74 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  29.87 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  30.43 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  29.39 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>