273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1894 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  100 
 
 
276 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  53.85 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  49.08 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  47.29 
 
 
280 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  47.29 
 
 
280 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  46.97 
 
 
304 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  41.64 
 
 
281 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  41.01 
 
 
291 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  38.21 
 
 
434 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  37.5 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  34.02 
 
 
292 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  38.43 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  38.04 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  38.15 
 
 
291 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.85 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  37.5 
 
 
288 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  35.94 
 
 
284 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  36.53 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  36.3 
 
 
277 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36.76 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.6 
 
 
351 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  40.96 
 
 
283 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.8 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  39.42 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  35.16 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  35.62 
 
 
281 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  34.3 
 
 
285 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.29 
 
 
288 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  34.57 
 
 
274 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.66 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  35.27 
 
 
279 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  33.21 
 
 
272 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  35.9 
 
 
250 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  38.16 
 
 
279 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  35.11 
 
 
281 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  32.58 
 
 
280 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  29.78 
 
 
281 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.03 
 
 
274 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  32.21 
 
 
279 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  36.07 
 
 
278 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  33.7 
 
 
294 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  33.45 
 
 
584 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.37 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  33.96 
 
 
276 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  37.36 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.96 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.59 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  33.09 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  34.2 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.79 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  35.34 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.29 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.27 
 
 
306 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  35.94 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  31.37 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.38 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.53 
 
 
294 aa  92  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  34.19 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.16 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.1 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.91 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.5 
 
 
310 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.2 
 
 
289 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.25 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  35.23 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.45 
 
 
280 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.28 
 
 
292 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.8 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  33.33 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  30.71 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  34.32 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  34.32 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  36.86 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.25 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  30.5 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  30.77 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  32.71 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.43 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  35.87 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.86 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.91 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  33.45 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.64 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  26.3 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.33 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  32.75 
 
 
276 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.89 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.16 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.28 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.77 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.64 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  32.33 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  32.45 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  32.64 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  31.74 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.49 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  34.8 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>