More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1659 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 313 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3625  transcriptional regulator, LysR family  57.14 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2476  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6799  transcriptional regulator, LysR family  52.29 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  50.32 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  37.98 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3644  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  35.81 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0607  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.822767  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  34.18 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0547  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  36.59 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1437  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.4 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  36.56 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.56 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.85 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4891  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0719515  hitchhiker  0.000498702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.03 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  36.32 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02668  transcriptional regulator, LysR family protein  29.29 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2928  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  23.77 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 408 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  34.38 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1471  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  36.41 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3649  lysR-family transcriptional regulatory protein  29.02 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5155  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3953  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>