216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3609 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  99.54 
 
 		 924 aa  1733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 976 aa  1944    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  49.21 
 
 		 968 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.65 
 
 		 983 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  29.23 
 
 		 992 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  33.37 
 
 		 988 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  32.74 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  33.71 
 
 		 988 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  33.26 
 
 		 988 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  33.26 
 
 		 988 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  34.13 
 
 		 988 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  33.26 
 
 		 988 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  33.26 
 
 		 988 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  32.85 
 
 		 988 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  28.72 
 
 		 987 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  33.51 
 
 		 1015 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  32.78 
 
 		 988 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.38 
 
 		 988 aa  399  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.38 
 
 		 988 aa  399  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  33.47 
 
 		 988 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  33.47 
 
 		 988 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  32.64 
 
 		 989 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  32.54 
 
 		 988 aa  396  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  33.3 
 
 		 988 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 		 985 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  32.7 
 
 		 964 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  32.51 
 
 		 990 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  32.51 
 
 		 990 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  32.37 
 
 		 990 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  32.37 
 
 		 990 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  32.37 
 
 		 990 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  32.37 
 
 		 990 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  32.37 
 
 		 990 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  31.48 
 
 		 989 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.57 
 
 		 988 aa  376  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.57 
 
 		 988 aa  376  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.57 
 
 		 988 aa  376  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 		 994 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 		 994 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.49 
 
 		 994 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  32.91 
 
 		 988 aa  354  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  32.81 
 
 		 988 aa  352  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.8 
 
 		 996 aa  351  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  31.42 
 
 		 862 aa  348  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  33.86 
 
 		 755 aa  343  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  30.09 
 
 		 991 aa  343  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.59 
 
 		 997 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  30.86 
 
 		 999 aa  340  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  30.62 
 
 		 991 aa  340  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  30.62 
 
 		 991 aa  340  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  44.61 
 
 		 423 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.18 
 
 		 996 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.18 
 
 		 996 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.18 
 
 		 996 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  37.63 
 
 		 606 aa  337  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  32.46 
 
 		 992 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 992 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.71 
 
 		 988 aa  324  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.5 
 
 		 991 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.5 
 
 		 991 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  30 
 
 		 983 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  31.86 
 
 		 877 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 		 550 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  33.81 
 
 		 771 aa  285  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  28.78 
 
 		 961 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  29.44 
 
 		 1028 aa  271  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  38.9 
 
 		 435 aa  268  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  28.31 
 
 		 1075 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 371 aa  254  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  26.92 
 
 		 1029 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.55 
 
 		 772 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  40.71 
 
 		 338 aa  240  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  28.45 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  26.54 
 
 		 986 aa  234  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 		 990 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  32.49 
 
 		 573 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  24.97 
 
 		 1013 aa  232  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  27.07 
 
 		 738 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  26.22 
 
 		 1059 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  26.73 
 
 		 1018 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.53 
 
 		 993 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 		 993 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24.55 
 
 		 990 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.31 
 
 		 999 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.31 
 
 		 999 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.31 
 
 		 999 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.31 
 
 		 999 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.69 
 
 		 1012 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  31.39 
 
 		 546 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 977 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.38 
 
 		 994 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 977 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  27.88 
 
 		 613 aa  210  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.48 
 
 		 995 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  24.63 
 
 		 929 aa  204  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.17 
 
 		 989 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  22.99 
 
 		 995 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  25.96 
 
 		 1028 aa  201  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.84 
 
 		 974 aa  201  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  24.39 
 
 		 1015 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>