More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3230 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  57.23 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  54 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  58.31 
 
 		 313 aa  308  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  52.73 
 
 		 354 aa  281  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  46.01 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  45.63 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  44.73 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  42.77 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  44.9 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  45.98 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  44.77 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  45.48 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  42.9 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  43.99 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  45.83 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  43.04 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  46.5 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  41.16 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  42.72 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  44.59 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  41.56 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  41.29 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  43.09 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  40.91 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  41.85 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  41.67 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  42.81 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  41.48 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  41.37 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  39.94 
 
 		 363 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  40.06 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  41.21 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  42.77 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.25 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.59 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.41 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.04 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.51 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.17 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.39 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  36.1 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.1 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.37 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.37 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.59 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.46 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.75 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  35.56 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  35.56 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.91 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  35.56 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.89 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.06 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.97 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.49 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.04 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.86 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  33.23 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  33.23 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  31.33 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.33 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.7 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.93 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.06 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.12 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.92 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  34.48 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.03 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.08 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  32.18 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  36.77 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.7 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.44 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.58 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  35.09 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  32.64 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  29.69 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  35.68 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  33.44 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  33.33 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.1 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.16 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.43 
 
 		 402 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  34.38 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.21 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.19 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  30.91 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.16 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  38.12 
 
 		 448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  34.59 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  32.09 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.53 
 
 		 404 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.82 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  29.07 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.17 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.71 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>