More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3089 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3089  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 734 aa  1478    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000640633  hitchhiker  0.0000151217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  58.81 
 
 		 701 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 		 709 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 700 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  46.68 
 
 		 714 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  46.97 
 
 		 733 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  45.88 
 
 		 715 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.2 
 
 		 719 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  46.94 
 
 		 730 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  45.68 
 
 		 721 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.51 
 
 		 708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  45.86 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  46.65 
 
 		 712 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  45.89 
 
 		 723 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.13 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2939  glycogen debranching enzyme GlgX  50.21 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 720 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  45.01 
 
 		 718 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  47.68 
 
 		 712 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  44.94 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 713 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 		 721 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 752 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 		 712 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  47.39 
 
 		 712 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  48.19 
 
 		 802 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.97 
 
 		 704 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.17 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.06 
 
 		 720 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  43.67 
 
 		 726 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  46.13 
 
 		 701 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  45.17 
 
 		 722 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  45.47 
 
 		 722 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  45.25 
 
 		 751 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  45.17 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  45.95 
 
 		 716 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 711 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  45.68 
 
 		 716 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  45.4 
 
 		 721 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  44.51 
 
 		 720 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.97 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  45.87 
 
 		 1537 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  45.02 
 
 		 779 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 711 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  46.13 
 
 		 701 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  44.34 
 
 		 704 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.31 
 
 		 707 aa  539  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 711 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  46 
 
 		 757 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  46.03 
 
 		 711 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  47.68 
 
 		 703 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  44.44 
 
 		 727 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.8 
 
 		 701 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 723 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  44.34 
 
 		 721 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  44.02 
 
 		 717 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  43.78 
 
 		 717 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  43.25 
 
 		 727 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  42.6 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  46.35 
 
 		 729 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  43.73 
 
 		 830 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.01 
 
 		 755 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.27 
 
 		 738 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  45.72 
 
 		 727 aa  535  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 1464 aa  535  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.02 
 
 		 779 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  45.1 
 
 		 720 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  43.97 
 
 		 745 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  43.52 
 
 		 719 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  43.81 
 
 		 710 aa  531  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  44.46 
 
 		 714 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  44.55 
 
 		 733 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  43.5 
 
 		 717 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  46.09 
 
 		 709 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.48 
 
 		 722 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43.78 
 
 		 717 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  43.99 
 
 		 738 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  44.55 
 
 		 776 aa  527  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  44.27 
 
 		 728 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.58 
 
 		 755 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.72 
 
 		 715 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  46.91 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  46.01 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 758 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  43.51 
 
 		 733 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 758 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  45.58 
 
 		 727 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  41.96 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  45.63 
 
 		 701 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 718 aa  525  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 756 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  46.5 
 
 		 717 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  46.59 
 
 		 708 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  44.77 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  42.33 
 
 		 845 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  49.12 
 
 		 738 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>