153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1332 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 394 aa  762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  48.57 
 
 		 412 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  48.83 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  51.94 
 
 		 421 aa  345  8e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  48.03 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  46.07 
 
 		 442 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  46.34 
 
 		 410 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  47.53 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  38.54 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  35.25 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  37.07 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  36.29 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  34.29 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  34.78 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.28 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  36.47 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  32.17 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  33.86 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33.67 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.91 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  26.16 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  31.78 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  42.59 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  31.63 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  36.67 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  31.67 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.87 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  26.94 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  30.5 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  28.24 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.48 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.26 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.06 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  27.31 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  28.01 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.82 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  31 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.87 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  34.59 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.57 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.44 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.44 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  22.61 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.2 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.44 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  29.06 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  29.69 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  33.01 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.6 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.85 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.19 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  28.98 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.99 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  27.85 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.17 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  26.35 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  37.93 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  34.78 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  27.22 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.91 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  33.72 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  32.8 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  28.84 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.29 
 
 		 294 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.7 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.35 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 		 299 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  29.48 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  28.48 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  34.88 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  45.65 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  32.19 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  27.43 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  21.03 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  37.18 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  31.01 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  29.27 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  31.63 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  40.28 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  28.81 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  22.22 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  34.86 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  34.78 
 
 		 428 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  35.38 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  35.94 
 
 		 455 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>