More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0973 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 430 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  66.43 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  63.25 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  61.16 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  61.63 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  63.01 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  63.07 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  61.87 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  58.49 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  62.03 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  62 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  59.38 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  58.89 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  59.04 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  59.29 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  54.4 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  55.29 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  53.19 
 
 		 431 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  53.77 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  52.96 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  51.87 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  49.3 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  50.23 
 
 		 444 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  44.22 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  36.5 
 
 		 436 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  36.8 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  35.99 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  34.2 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  35.05 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  34.55 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  34.06 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  32.81 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  34.3 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  32.29 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.28 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  36.31 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  32.01 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  34.97 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.52 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.94 
 
 		 420 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.74 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.06 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  36.03 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.05 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.95 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.95 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.22 
 
 		 396 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  29.88 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.44 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.82 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.82 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.56 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 390 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.65 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.47 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  29.04 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  31.89 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.2 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  27.85 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>