More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0557 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 299 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  34.91 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1184  hypothetical protein  29.97 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1178  hypothetical protein  29.62 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4521  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  26.3 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.37 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.56 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  25.3 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.85 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  20.3 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.27 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  28.26 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  23.41 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  24.43 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  33.51 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  35.85 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  27.78 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  29.06 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>