More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3901 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  100 
 
 
369 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  67.95 
 
 
346 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  59.93 
 
 
320 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  60.87 
 
 
323 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  57.01 
 
 
339 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  53.61 
 
 
348 aa  371  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  47.16 
 
 
295 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  43.99 
 
 
304 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  37.55 
 
 
296 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  37.55 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  32.31 
 
 
301 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  35.16 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  34.56 
 
 
303 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  33.56 
 
 
292 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  33.22 
 
 
305 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  31.03 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  30.07 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  30.07 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  30.51 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  32.35 
 
 
304 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  27.95 
 
 
299 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  30.56 
 
 
313 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  31.21 
 
 
306 aa  133  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  29.05 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  30.61 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 
292 aa  127  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  28.91 
 
 
316 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  28.26 
 
 
319 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  27.61 
 
 
300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  31.56 
 
 
303 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.46 
 
 
297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  27.33 
 
 
287 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  31.65 
 
 
295 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  27.27 
 
 
316 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  25.68 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  25.68 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.3 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  26.3 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  26.3 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  24.54 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
302 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  26.46 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.77 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
269 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.77 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  26.12 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  27.46 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  22.34 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  29.71 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  26.38 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  35.25 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  23.08 
 
 
278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2058  proline iminopeptidase  27.11 
 
 
324 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  24.1 
 
 
298 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  24.83 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  29.55 
 
 
320 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  30.77 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  25.7 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  22.44 
 
 
425 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  28.32 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  24.16 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  21.23 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  26.67 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29.51 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  31.07 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  30.77 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  29.23 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  29.41 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  28.57 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  21.38 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  20.07 
 
 
316 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  27.19 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  22.53 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  27.82 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  28.04 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  22.61 
 
 
301 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  21.11 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  25.87 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  27.27 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  26.06 
 
 
330 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
280 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  30.37 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
270 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  25 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  27.67 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  22.26 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  28.12 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  21.05 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  21.5 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  20.82 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>