More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1894 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  100 
 
 		 329 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  85.32 
 
 		 329 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  76.45 
 
 		 329 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  66.26 
 
 		 330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  67.28 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  49.84 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  48.08 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  47.21 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  47.28 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  47.28 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  48.08 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  48.87 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  47.59 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  46.79 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  45.6 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  46.13 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  46.89 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  48.52 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  46.89 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  45.71 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  47.77 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  49.18 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  45.54 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  47.87 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  45.86 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  46.28 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 429 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 429 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  48.2 
 
 		 429 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  45.48 
 
 		 318 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  46.56 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  46.56 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  47.87 
 
 		 436 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  46.23 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  45.79 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  45.54 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  42.53 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  42.54 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  45.9 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  43.91 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  47.39 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  43.13 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  44.19 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  41.37 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  44.33 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  43.13 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  42.86 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  40.58 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  39.16 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  42.39 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  44.48 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  42.81 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  40.58 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  40.58 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  40.58 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  43.4 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  40.26 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  41.88 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  43.83 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  43.33 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  43.83 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  42.53 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  42.62 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  42.95 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  42.57 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  40 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  42.02 
 
 		 313 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  42.02 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  42.67 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  47.77 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  42.35 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  45.83 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  38.96 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  41.16 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  39 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  37.21 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  41.86 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  41.86 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  43.27 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  42.16 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  40.85 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  42.49 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  41.69 
 
 		 329 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  43.45 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  42.68 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  37.09 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  40.52 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  39.52 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  43.2 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  35.64 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2058  proline iminopeptidase  39.87 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  40.52 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  34.98 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  38.06 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>