More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1479 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  100 
 
 
321 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  74.84 
 
 
320 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  74.21 
 
 
320 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  74.21 
 
 
320 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  71.29 
 
 
317 aa  487  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  71.29 
 
 
318 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  71.29 
 
 
317 aa  487  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  71.43 
 
 
317 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  69.47 
 
 
321 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  69.4 
 
 
320 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  64.72 
 
 
310 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  65.7 
 
 
310 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  64.19 
 
 
326 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  64.84 
 
 
310 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  64.4 
 
 
310 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  64.84 
 
 
310 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  64.4 
 
 
310 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  64.08 
 
 
310 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  64.97 
 
 
429 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  64.97 
 
 
429 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  65.29 
 
 
436 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  64.97 
 
 
429 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  65.37 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  65.37 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  65.37 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  63.06 
 
 
414 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  60.06 
 
 
317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  62.58 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  60.25 
 
 
318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  58.23 
 
 
316 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  57.91 
 
 
316 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  57.91 
 
 
316 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  59.62 
 
 
319 aa  394  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  57.74 
 
 
320 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  57.51 
 
 
326 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  56.6 
 
 
319 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  59.29 
 
 
311 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  57.83 
 
 
313 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  57.69 
 
 
313 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  57.05 
 
 
313 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  55.91 
 
 
313 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  55.45 
 
 
316 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  57.88 
 
 
316 aa  364  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  57.88 
 
 
342 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  51.75 
 
 
323 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  52.06 
 
 
323 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  54.26 
 
 
328 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  52.4 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  53.04 
 
 
323 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  51.75 
 
 
323 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  57.86 
 
 
321 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  51.75 
 
 
323 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  51.75 
 
 
323 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  57.23 
 
 
316 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  50.16 
 
 
323 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
323 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  56.96 
 
 
329 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  51.43 
 
 
323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  51.75 
 
 
323 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  51.52 
 
 
330 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  50.32 
 
 
332 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  46.52 
 
 
323 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  52.72 
 
 
316 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  53.67 
 
 
316 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  49.84 
 
 
326 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  53.21 
 
 
328 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  51.32 
 
 
316 aa  325  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  49.68 
 
 
320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  52.44 
 
 
322 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  47.56 
 
 
316 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  48.9 
 
 
321 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  46.73 
 
 
316 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  47.23 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  51.79 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  51.47 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  49.51 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  46.37 
 
 
320 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  46.82 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  46.82 
 
 
316 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  45.74 
 
 
322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  45.98 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  47.63 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  44.83 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  44.82 
 
 
313 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  44.73 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  43.73 
 
 
313 aa  285  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  45.93 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  46.35 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  44.55 
 
 
318 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  45.22 
 
 
323 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  46.79 
 
 
318 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  47.15 
 
 
321 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  44.34 
 
 
319 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  47.06 
 
 
315 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  42.63 
 
 
320 aa  275  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  41.46 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  45.74 
 
 
320 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  41.35 
 
 
315 aa  272  6e-72  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  39.81 
 
 
319 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  39.81 
 
 
319 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>