236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40124 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  100 
 
 
345 aa  716    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  35.06 
 
 
360 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  30.81 
 
 
286 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  29.13 
 
 
303 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  42.72 
 
 
292 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  26.16 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  41.57 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  28.81 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  28.93 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  24.08 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  23.47 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  31.29 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  29.61 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.01 
 
 
297 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  27.73 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  24.49 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  31.78 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  27.17 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  26.54 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  27.96 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  25.46 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  29.93 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  22.39 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  36.17 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  35.11 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  25.43 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  27.72 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  33.63 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  25.45 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  28.57 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  25.82 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
303 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  31.52 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  30.95 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  37.5 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  33.98 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
282 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
284 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  37.63 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
258 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.06 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  27.59 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  31.58 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 
271 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  36.26 
 
 
323 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  25.99 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  33.05 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  28.16 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  32.58 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
273 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
261 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  36.56 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
261 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  25.35 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  35.71 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  21.98 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  24.71 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  33.93 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  31.21 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  31.21 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  36.56 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  34.44 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  30.97 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  30.57 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  28.07 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  29.3 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  26.72 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  33.01 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  30.97 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  32.29 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>