265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0261 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  100 
 
 
348 aa  724    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  57.93 
 
 
346 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  53.61 
 
 
369 aa  371  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  53.82 
 
 
339 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  52.17 
 
 
323 aa  349  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  50 
 
 
320 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  42.4 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  40.75 
 
 
304 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  33.79 
 
 
301 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  34.01 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  35.09 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  34.72 
 
 
296 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  32.97 
 
 
303 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  33.76 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  30.88 
 
 
286 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  29.66 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  30.98 
 
 
307 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  32.04 
 
 
304 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  30.9 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  27.78 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  27.78 
 
 
300 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  28.86 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  27.43 
 
 
299 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.43 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  28.48 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  28.52 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  25.08 
 
 
300 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  27.21 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  24.13 
 
 
292 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  26.92 
 
 
306 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  26.62 
 
 
296 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  27.64 
 
 
295 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  27.7 
 
 
298 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  27.55 
 
 
316 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  26.85 
 
 
298 aa  90.1  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  27.8 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  23.71 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.02 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  26.79 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  22.94 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  22.33 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
265 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  22.57 
 
 
425 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
294 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  24.73 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  28.46 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  19.65 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  20.78 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
378 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  28.35 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  29.03 
 
 
316 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
293 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  23.05 
 
 
277 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  26.05 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2502  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2432  alpha/beta fold family hydrolase  22.99 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2687  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  28 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  23.05 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  37.5 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  26.11 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  33.68 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4779  proline iminopeptidase  26.37 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  21.29 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  23.08 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  21.71 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  22.58 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  23.08 
 
 
298 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 
269 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.89 
 
 
269 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  24.81 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  23.24 
 
 
269 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
296 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  19.73 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  22.89 
 
 
269 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  25.95 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4497  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
287 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 
310 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  22.88 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 
269 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>