More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5407 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  41.5 
 
 
299 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  42.86 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  40.14 
 
 
319 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  41.84 
 
 
306 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  35.96 
 
 
297 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  38.91 
 
 
313 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  37.2 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  36.39 
 
 
300 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  36 
 
 
300 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  40.14 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  34.59 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  33.9 
 
 
292 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  33.22 
 
 
286 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  34.48 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  33.1 
 
 
297 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  32.28 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  31.45 
 
 
296 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  31.91 
 
 
296 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  29.93 
 
 
295 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  28.79 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  29.05 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  28.41 
 
 
298 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  28.98 
 
 
346 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  28.72 
 
 
295 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  30.35 
 
 
286 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  29.87 
 
 
323 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  27.33 
 
 
369 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  29.96 
 
 
316 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  30.69 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  26.44 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  27.46 
 
 
302 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  25.75 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  25.42 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.8 
 
 
348 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  30.54 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  24.29 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  25.57 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  28.93 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.2 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  28.23 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  27 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.24 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  25.97 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.19 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.21 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  24.09 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.94 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.89 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.56 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  40.48 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.56 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.14 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  37.5 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  35.65 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.88 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.22 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  36.07 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  36.64 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
387 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  35.94 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27 
 
 
425 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
256 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  34.19 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  38.28 
 
 
339 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  35 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  35.94 
 
 
328 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  38.52 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>