More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24200 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  100 
 
 
316 aa  657    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  56.79 
 
 
295 aa  335  7e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  57.72 
 
 
298 aa  328  9e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  54.7 
 
 
298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  33.68 
 
 
319 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  35.14 
 
 
300 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  35.14 
 
 
300 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  33.45 
 
 
306 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  35.42 
 
 
316 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  32.98 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  30.98 
 
 
300 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  34.69 
 
 
307 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  33.22 
 
 
297 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  31.9 
 
 
305 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  34.27 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  29.54 
 
 
296 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  30.71 
 
 
286 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  29.45 
 
 
295 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  31.67 
 
 
292 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  31.54 
 
 
303 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  27.27 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  30.39 
 
 
304 aa  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  29.33 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  30.1 
 
 
320 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  29.43 
 
 
297 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  29.24 
 
 
303 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  29.96 
 
 
287 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  25.99 
 
 
304 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.55 
 
 
348 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  25.3 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  27.34 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  27.27 
 
 
369 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  26.1 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  25.93 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  23.67 
 
 
292 aa  89  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  26.41 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  25 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  23.53 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  22.96 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  29.93 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  32.91 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  22.42 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  24.82 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.29 
 
 
278 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  24.82 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  24.1 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  23.9 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  23.55 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  23.55 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8373  proline iminopeptidase  30.6 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  31.13 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  24.13 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  23.19 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
286 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  31.4 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  24.32 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.62 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  33.64 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  31.4 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  31.41 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  31.36 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  23.74 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  33.96 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  24.15 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  25 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  25 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  31.21 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  32.41 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  33.02 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  30.77 
 
 
360 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
269 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  27.46 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  23.43 
 
 
414 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  29.2 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  31.19 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  34.21 
 
 
341 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  30.97 
 
 
361 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  23.93 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  25.56 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  23.93 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  22.99 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  23.93 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>