More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0052 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  86.38 
 
 		 303 aa  543  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  46 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  40.13 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  39.34 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  36.05 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  38.33 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  35.44 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  32.57 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  32.41 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  31.05 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  32.04 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  34.88 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  32.04 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  33 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  32.35 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  28.57 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  29.72 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  29.45 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  30.39 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  28.12 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  27.37 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  29.83 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  29.07 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.12 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  27.68 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  27.82 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  28.91 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  26.48 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  27.08 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  27.3 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  30.83 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  25.94 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  26.94 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  25.74 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  25.75 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  25.27 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.65 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  23.57 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  25.26 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  21.14 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  21.98 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.13 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  22.7 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  20.51 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  23.18 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  21.7 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  22.5 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  21.53 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  21.94 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  22.07 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  22.76 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  21.63 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  22.84 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  20.61 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  24.35 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.35 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  21.19 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  22.03 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  21.71 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  21.67 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  20.6 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.88 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.65 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  25.08 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  21.13 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  20.93 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  20.43 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  20.54 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0781  abhydrolase  32.1 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  20.54 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  22.85 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>