More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  100 
 
 
295 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  56.86 
 
 
298 aa  342  5.999999999999999e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  56.79 
 
 
316 aa  335  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  55.85 
 
 
298 aa  334  9e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  39.32 
 
 
300 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  38.85 
 
 
300 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  36.81 
 
 
319 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  36.64 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  34.81 
 
 
307 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  34.22 
 
 
299 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  35.12 
 
 
306 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  33.33 
 
 
305 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  35.49 
 
 
316 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  35.74 
 
 
313 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  32.88 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  32.41 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  31.46 
 
 
296 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  33.45 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  31.96 
 
 
286 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  28.57 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  32.08 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  29.72 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  30.31 
 
 
303 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  29.45 
 
 
296 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  27.02 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  29.11 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  27.33 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.77 
 
 
323 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  28.72 
 
 
287 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  28.87 
 
 
346 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  26.96 
 
 
303 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  29.96 
 
 
320 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.64 
 
 
348 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  31.65 
 
 
369 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  26.57 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  22.94 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  28.81 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  24.4 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.27 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.72 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  22.69 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  24 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  33.61 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  36.27 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  33.61 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  27.21 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  35.29 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  30.89 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  27.4 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  34.86 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  26.5 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  34.86 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  27.21 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  27.21 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  35.19 
 
 
323 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  23.5 
 
 
268 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  26.22 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  32.23 
 
 
323 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  27.21 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  27.68 
 
 
316 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  36.36 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  22.71 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  38.14 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  26.86 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  33.94 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  25.89 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  34.26 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.44 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  27.2 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  27.55 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  31.19 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  24.64 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  25.73 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  27.81 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  26.07 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  26.34 
 
 
325 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  27.81 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  22.66 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  31.93 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  23.28 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  26.4 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  22.11 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  22.91 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  30.47 
 
 
429 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  30.47 
 
 
429 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  34.78 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  30.47 
 
 
429 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  26.92 
 
 
414 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  35.58 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>