More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0035 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  100 
 
 
320 aa  655    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  67.21 
 
 
323 aa  427  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  59.93 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  58.28 
 
 
346 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  50.64 
 
 
339 aa  339  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  50 
 
 
348 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  50.49 
 
 
295 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  40.53 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  34.01 
 
 
301 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  38.58 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  38.41 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  38.58 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  34.07 
 
 
303 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  33.56 
 
 
303 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  34.62 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  33 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  35.87 
 
 
306 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  34.71 
 
 
313 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  31.02 
 
 
303 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  30.48 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  31.53 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  29.57 
 
 
292 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  30.29 
 
 
300 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  30.17 
 
 
307 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  32.34 
 
 
296 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  31.99 
 
 
316 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  29.74 
 
 
306 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  32.73 
 
 
319 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  29.93 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.51 
 
 
297 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  30.1 
 
 
316 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  27.84 
 
 
298 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  28.77 
 
 
298 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  29.96 
 
 
295 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  30.69 
 
 
287 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25 
 
 
286 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  28.41 
 
 
297 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  24.92 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  22.48 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  31.03 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  35.38 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  34.62 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  33.06 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  22.92 
 
 
278 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  32.56 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  33.06 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  29.93 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  32.06 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  35.83 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  36.84 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  35.83 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  35.83 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  35.83 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  26.91 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  29.93 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  28.46 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  29.23 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  31.3 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.46 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  25.57 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  30.53 
 
 
322 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
282 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  26.24 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  36.79 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  34.68 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  31.58 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
282 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  29.2 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29.27 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  27.16 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  23.76 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  34.13 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  34.48 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  33.63 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  28.47 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  24.11 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  30 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  30.43 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>