53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48133 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  100 
 
 
360 aa  747    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  35.06 
 
 
345 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  29.43 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  25.09 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  29.59 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  28.23 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  25.4 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  24.64 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.4 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  27.08 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  25 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  26.25 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  25.53 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  21.94 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 
303 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  21.3 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  23.64 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  21.66 
 
 
300 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  37.07 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  23.64 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  23.99 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  23.46 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  25.52 
 
 
297 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  30.77 
 
 
316 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  22.94 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  22.64 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  25.13 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
282 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  23.02 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  25.9 
 
 
298 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  27.46 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  21.63 
 
 
295 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  25.48 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  25.09 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 
258 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  23.49 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  21.36 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  33.72 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  33.72 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  21.51 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  21.22 
 
 
348 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  21.11 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  21.28 
 
 
296 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>