More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2620 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  100 
 
 
320 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  87.5 
 
 
326 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  54.11 
 
 
319 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2058  proline iminopeptidase  49.68 
 
 
324 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  48.42 
 
 
322 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  50.78 
 
 
321 aa  315  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  52.56 
 
 
308 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  48.43 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  48.43 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  51.59 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5441  proline iminopeptidase  50.32 
 
 
327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  49.36 
 
 
311 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  51.43 
 
 
429 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  51.43 
 
 
429 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  51.43 
 
 
429 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
436 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  51.11 
 
 
312 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  51.11 
 
 
312 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  50.79 
 
 
320 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  51.11 
 
 
312 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  49.68 
 
 
317 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  49.68 
 
 
317 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  48.57 
 
 
310 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  46.86 
 
 
318 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  50.96 
 
 
414 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  49.37 
 
 
319 aa  291  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  49.68 
 
 
332 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  47.62 
 
 
320 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  48.58 
 
 
318 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  47.32 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  47.15 
 
 
310 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  46.84 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  46.84 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  46.52 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  47.78 
 
 
310 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  47.47 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  47.15 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  48.41 
 
 
326 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  46.52 
 
 
320 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  48.71 
 
 
312 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  47.95 
 
 
321 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  46.37 
 
 
320 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  46.84 
 
 
329 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  45.74 
 
 
321 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  44.1 
 
 
316 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  46.35 
 
 
328 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  45.45 
 
 
313 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  43.81 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  44.51 
 
 
313 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  46.31 
 
 
325 aa  262  6e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  42.54 
 
 
316 aa  262  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  42.54 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  42.54 
 
 
316 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  44.65 
 
 
313 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  45.11 
 
 
326 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  45.08 
 
 
321 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  44.34 
 
 
313 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  43.08 
 
 
317 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  43.89 
 
 
326 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  43.17 
 
 
316 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  43.17 
 
 
342 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  46.93 
 
 
312 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  44.59 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  41.19 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  43.04 
 
 
316 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  42.14 
 
 
323 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  42.09 
 
 
320 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  41.19 
 
 
323 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  44.27 
 
 
315 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  40.89 
 
 
323 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  43.71 
 
 
328 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  40.25 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  39.31 
 
 
323 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  39.31 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  39.31 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  39.31 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  39.31 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  41.27 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  43.08 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  42.22 
 
 
333 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  39.94 
 
 
323 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  40.75 
 
 
316 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  40.13 
 
 
319 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36840  proline iminopeptidase  44.48 
 
 
316 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0362084  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  41.59 
 
 
320 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  44.09 
 
 
316 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  42.32 
 
 
328 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  38.41 
 
 
323 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  39.54 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  44.9 
 
 
322 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  44.44 
 
 
315 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  39.87 
 
 
318 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  40.44 
 
 
316 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  38.82 
 
 
320 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  42.68 
 
 
321 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  42.68 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  36.74 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  35.22 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  37.42 
 
 
316 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  37.42 
 
 
316 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>