120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_07011 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  100 
 
 
314 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  97.77 
 
 
314 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  57.84 
 
 
332 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  56.23 
 
 
314 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  58.63 
 
 
311 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  59.68 
 
 
310 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  59.35 
 
 
310 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  53.17 
 
 
337 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  58.63 
 
 
317 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  56.15 
 
 
317 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  60 
 
 
310 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  58.12 
 
 
310 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  54.31 
 
 
320 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  52.87 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  54.92 
 
 
320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  51.75 
 
 
319 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  50.16 
 
 
319 aa  338  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  53.53 
 
 
322 aa  338  8e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  50.94 
 
 
329 aa  331  8e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  53.49 
 
 
358 aa  324  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  49.01 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  49.5 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  44.19 
 
 
364 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  46.36 
 
 
318 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.11 
 
 
351 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  43.17 
 
 
344 aa  275  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  45.6 
 
 
337 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 
352 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  43.23 
 
 
351 aa  271  9e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  41.04 
 
 
318 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  44.59 
 
 
351 aa  265  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  46.69 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
335 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 
337 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.44 
 
 
335 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  42.23 
 
 
338 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  43.91 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  42.91 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  44.87 
 
 
328 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 
319 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
341 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 
329 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 
329 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
800 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 
468 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
347 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
1005 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  25.33 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  30 
 
 
429 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  23.38 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
565 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
459 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 
440 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 
412 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.97 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.66 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
1000 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
396 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  27.71 
 
 
595 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.57 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 
378 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
382 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.66 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 
482 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
1002 aa  46.2  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 
417 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.34 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 
395 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  31.87 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 
418 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 
529 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.85 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.86 
 
 
491 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  36.51 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  25.52 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  27.27 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.27 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.97 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>