More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1969 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  100 
 
 
337 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  97.83 
 
 
322 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  89.75 
 
 
322 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  87.27 
 
 
322 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  82.61 
 
 
322 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  83.54 
 
 
322 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  66.15 
 
 
322 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625528  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35520  Molybdenum cofactor biosynthesis protein  62.22 
 
 
287 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  39.33 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.92 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.92 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.57 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  37.72 
 
 
337 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.86 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.21 
 
 
329 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.81 
 
 
355 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.15 
 
 
340 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.47 
 
 
344 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.13 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.06 
 
 
321 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.93 
 
 
344 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.94 
 
 
327 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.53 
 
 
333 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.32 
 
 
344 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
348 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
345 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.91 
 
 
335 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.23 
 
 
340 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.18 
 
 
342 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.18 
 
 
342 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.07 
 
 
322 aa  169  9e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.15 
 
 
342 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.62 
 
 
344 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.59 
 
 
344 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.41 
 
 
329 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
344 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.38 
 
 
348 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.18 
 
 
321 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.75 
 
 
341 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.49 
 
 
343 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.95 
 
 
332 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.79 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.39 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.3 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.77 
 
 
322 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.21 
 
 
327 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.4 
 
 
328 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.99 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  34.17 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.51 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.93 
 
 
337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.27 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  39.5 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.4 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.98 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.51 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.11 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.05 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  37.17 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.4 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.14 
 
 
326 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  33.54 
 
 
343 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.62 
 
 
349 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.82 
 
 
366 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.98 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.35 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.94 
 
 
351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.43 
 
 
345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.43 
 
 
322 aa  162  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 
327 aa  162  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.71 
 
 
344 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.75 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.4 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.21 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.93 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.26 
 
 
330 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.46 
 
 
318 aa  162  9e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
328 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.44 
 
 
374 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.86 
 
 
408 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0273592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.27 
 
 
336 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.8 
 
 
322 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.51 
 
 
346 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.95 
 
 
326 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.91 
 
 
341 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.96 
 
 
326 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.41 
 
 
331 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.2 
 
 
344 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.28 
 
 
326 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  36.96 
 
 
340 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.16 
 
 
353 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.51 
 
 
337 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.52 
 
 
322 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.71 
 
 
345 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.91 
 
 
326 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.91 
 
 
326 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.91 
 
 
374 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
323 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>