More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6025 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  48.87 
 
 		 752 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 737 aa  1488    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  49.31 
 
 		 717 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  46.75 
 
 		 759 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  44.27 
 
 		 821 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  36.78 
 
 		 714 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.02 
 
 		 737 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  34.88 
 
 		 696 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 		 703 aa  321  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 		 703 aa  321  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  34.4 
 
 		 705 aa  318  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  32.48 
 
 		 704 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  32.48 
 
 		 704 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.48 
 
 		 704 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 699 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  34.03 
 
 		 708 aa  287  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 712 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  33.71 
 
 		 659 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 690 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  36.25 
 
 		 603 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 706 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.19 
 
 		 696 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 		 716 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.63 
 
 		 711 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  29.44 
 
 		 683 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  31.7 
 
 		 685 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 662 aa  216  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  30.58 
 
 		 673 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.4 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.62 
 
 		 687 aa  200  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  30 
 
 		 734 aa  174  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 809 aa  160  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.66 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.98 
 
 		 1107 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.52 
 
 		 712 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 695 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.24 
 
 		 819 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 697 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 710 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.38 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 695 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.54 
 
 		 663 aa  97.4  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 671 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 564 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  30.3 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  30.08 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  30.83 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  30.12 
 
 		 613 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.95 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 907 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  28.19 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.03 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.01 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  27.06 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  30.53 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  27.09 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 682 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 1143 aa  64.3  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.78 
 
 		 704 aa  61.6  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0732  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1142 aa  60.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.5 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1421 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  22.43 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.57 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  26.97 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 702 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 719 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  34.34 
 
 		 465 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  27.09 
 
 		 610 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.09 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  22.76 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 725 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  26.02 
 
 		 726 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 709 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  26.69 
 
 		 616 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.39 
 
 		 607 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  33.33 
 
 		 709 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.27 
 
 		 785 aa  54.7  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1346  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1133  UvrD/REP helicase  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1127  ATP-dependent DNA helicase  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1239  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.74 
 
 		 657 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1279  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  39.74 
 
 		 688 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4063  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  39.74 
 
 		 688 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  39.74 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.48 
 
 		 691 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.39 
 
 		 607 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  22.62 
 
 		 515 aa  54.3  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  24.23 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 726 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5490  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996527  normal  0.395354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.09 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>