298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0083 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  100 
 
 
785 aa  1584    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  41.06 
 
 
776 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  41.19 
 
 
777 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  41.25 
 
 
777 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  41.04 
 
 
777 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  40.93 
 
 
776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  40.93 
 
 
776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  40.93 
 
 
776 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  40.71 
 
 
780 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  40.75 
 
 
778 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  40.26 
 
 
778 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  40.49 
 
 
768 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.02 
 
 
768 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  34.32 
 
 
764 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  32.67 
 
 
787 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.86 
 
 
772 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  32.85 
 
 
762 aa  389  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.63 
 
 
753 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  32.25 
 
 
702 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  31.07 
 
 
748 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  30.46 
 
 
702 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  29.84 
 
 
760 aa  295  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  27.41 
 
 
755 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  28.72 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  28.57 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  28.57 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  28.57 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  28.43 
 
 
689 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  28.43 
 
 
689 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  29.15 
 
 
689 aa  283  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.16 
 
 
763 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  28.41 
 
 
691 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.99 
 
 
763 aa  276  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  27.99 
 
 
691 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  28.12 
 
 
691 aa  273  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  27.01 
 
 
706 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  27.22 
 
 
706 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.79 
 
 
716 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.16 
 
 
698 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.58 
 
 
706 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.6 
 
 
736 aa  223  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  40.23 
 
 
269 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  41.53 
 
 
712 aa  174  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  25.59 
 
 
703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  28.31 
 
 
680 aa  128  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.97 
 
 
767 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  39.13 
 
 
666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.65 
 
 
672 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.59 
 
 
659 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.07 
 
 
670 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  34.89 
 
 
695 aa  118  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.84 
 
 
741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  36.5 
 
 
692 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  35.34 
 
 
799 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  34.06 
 
 
706 aa  114  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  34.78 
 
 
679 aa  114  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.55 
 
 
757 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  36.15 
 
 
750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  34.4 
 
 
719 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.55 
 
 
726 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  34.01 
 
 
726 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  32.41 
 
 
771 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  36.92 
 
 
759 aa  112  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.49 
 
 
829 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  37.67 
 
 
761 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.83 
 
 
645 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.05 
 
 
705 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.67 
 
 
732 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.15 
 
 
766 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  37.1 
 
 
706 aa  109  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  33.05 
 
 
705 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.32 
 
 
691 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  38.86 
 
 
765 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.12 
 
 
813 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.5 
 
 
710 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.39 
 
 
759 aa  107  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.69 
 
 
693 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.94 
 
 
832 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.73 
 
 
685 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.63 
 
 
695 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  35.78 
 
 
742 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  31.85 
 
 
727 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  37.44 
 
 
795 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.51 
 
 
724 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  34.51 
 
 
724 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  34.51 
 
 
724 aa  104  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.19 
 
 
804 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.63 
 
 
788 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.82 
 
 
746 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  31.1 
 
 
684 aa  102  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.82 
 
 
742 aa  101  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  32.43 
 
 
758 aa  100  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.12 
 
 
747 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  27.39 
 
 
852 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.03 
 
 
733 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.43 
 
 
786 aa  97.8  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  32.35 
 
 
902 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  31.37 
 
 
792 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.03 
 
 
735 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.04 
 
 
758 aa  96.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>