141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1511 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.17 
 
 		 757 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 742 aa  1488    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.76 
 
 		 741 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  49.34 
 
 		 759 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  90.3 
 
 		 742 aa  1358    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  59.39 
 
 		 758 aa  808    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.07 
 
 		 747 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  51.48 
 
 		 726 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  55.43 
 
 		 750 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.55 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  43.96 
 
 		 758 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  44.71 
 
 		 759 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.91 
 
 		 766 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.94 
 
 		 748 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  45.42 
 
 		 754 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  44.78 
 
 		 765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.65 
 
 		 813 aa  515  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  43.62 
 
 		 795 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  45.41 
 
 		 776 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  40.8 
 
 		 829 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.19 
 
 		 832 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.41 
 
 		 786 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.17 
 
 		 746 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.69 
 
 		 767 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  41.67 
 
 		 874 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.54 
 
 		 804 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  39.41 
 
 		 902 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.97 
 
 		 788 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  39.02 
 
 		 734 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  40.34 
 
 		 771 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.87 
 
 		 733 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  38.13 
 
 		 735 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  39.79 
 
 		 724 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  39.79 
 
 		 724 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  39.52 
 
 		 724 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.16 
 
 		 685 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.52 
 
 		 691 aa  333  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.46 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  34.29 
 
 		 799 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  35.6 
 
 		 703 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.22 
 
 		 705 aa  310  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  35.2 
 
 		 726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.77 
 
 		 764 aa  302  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  34.86 
 
 		 717 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.83 
 
 		 715 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  34.59 
 
 		 716 aa  287  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  34.62 
 
 		 705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  33.48 
 
 		 742 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  32.02 
 
 		 715 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  33.98 
 
 		 710 aa  278  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.52 
 
 		 732 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  32.86 
 
 		 761 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.29 
 
 		 728 aa  269  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  30.7 
 
 		 706 aa  258  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  33.56 
 
 		 717 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.38 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.31 
 
 		 755 aa  238  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  41.4 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.94 
 
 		 695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.79 
 
 		 659 aa  220  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.82 
 
 		 680 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  31.59 
 
 		 666 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  29.8 
 
 		 692 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.09 
 
 		 695 aa  210  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.37 
 
 		 670 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.08 
 
 		 1048 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.45 
 
 		 672 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.22 
 
 		 645 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  33.27 
 
 		 719 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  31.67 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  34.64 
 
 		 679 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.76 
 
 		 710 aa  158  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  33.13 
 
 		 792 aa  154  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  34.4 
 
 		 727 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.73 
 
 		 706 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.73 
 
 		 706 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.83 
 
 		 787 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  35.71 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  32.46 
 
 		 764 aa  118  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.09 
 
 		 755 aa  117  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  30.8 
 
 		 760 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.34 
 
 		 861 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.6 
 
 		 716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.87 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  35.89 
 
 		 712 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  32.1 
 
 		 762 aa  111  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.18 
 
 		 768 aa  109  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.35 
 
 		 698 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  34.43 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  31.37 
 
 		 702 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.96 
 
 		 777 aa  107  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>