132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2679 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 1048 aa  2100    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.68 
 
 		 861 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.16 
 
 		 659 aa  290  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.89 
 
 		 710 aa  283  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  34.86 
 
 		 692 aa  273  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  35.34 
 
 		 680 aa  273  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.87 
 
 		 645 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.88 
 
 		 672 aa  268  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  35.12 
 
 		 695 aa  263  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  32.4 
 
 		 792 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.33 
 
 		 695 aa  260  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.04 
 
 		 666 aa  260  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  33.19 
 
 		 679 aa  254  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  31.95 
 
 		 719 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  32.87 
 
 		 727 aa  249  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  33.18 
 
 		 717 aa  245  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.06 
 
 		 670 aa  244  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  32.22 
 
 		 684 aa  216  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.63 
 
 		 732 aa  208  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.85 
 
 		 693 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  28.63 
 
 		 726 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.99 
 
 		 705 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  31.49 
 
 		 703 aa  192  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  27.6 
 
 		 758 aa  191  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  27.82 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  27.46 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.51 
 
 		 724 aa  180  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  30.84 
 
 		 706 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  28.89 
 
 		 706 aa  178  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  29.97 
 
 		 705 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  25.18 
 
 		 689 aa  161  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  25.18 
 
 		 689 aa  161  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  25 
 
 		 689 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  25.04 
 
 		 689 aa  159  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.06 
 
 		 741 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.89 
 
 		 689 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.42 
 
 		 691 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.04 
 
 		 691 aa  154  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 761 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  23.5 
 
 		 703 aa  151  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.51 
 
 		 685 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  24.89 
 
 		 691 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  25.29 
 
 		 689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  31.56 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.89 
 
 		 691 aa  148  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.59 
 
 		 813 aa  148  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  30.38 
 
 		 759 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.63 
 
 		 748 aa  140  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.3 
 
 		 763 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  25.15 
 
 		 689 aa  137  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  35.28 
 
 		 799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  28.57 
 
 		 734 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  36.91 
 
 		 874 aa  134  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.89 
 
 		 763 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.41 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.23 
 
 		 759 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.82 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  26.72 
 
 		 712 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  27.12 
 
 		 771 aa  128  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  39.37 
 
 		 724 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  39.37 
 
 		 724 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  38.91 
 
 		 724 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  35.41 
 
 		 750 aa  124  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.32 
 
 		 757 aa  124  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.64 
 
 		 753 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  22.95 
 
 		 760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  29.33 
 
 		 902 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.82 
 
 		 758 aa  120  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.9 
 
 		 764 aa  119  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.69 
 
 		 804 aa  118  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.9 
 
 		 742 aa  118  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.88 
 
 		 747 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.71 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.94 
 
 		 788 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  22.48 
 
 		 778 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.22 
 
 		 754 aa  114  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  35.07 
 
 		 765 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.31 
 
 		 767 aa  114  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  31.44 
 
 		 829 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.82 
 
 		 832 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  38.7 
 
 		 776 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  22.41 
 
 		 706 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  22.65 
 
 		 706 aa  111  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.14 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  22.56 
 
 		 777 aa  110  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  22.09 
 
 		 748 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  27.99 
 
 		 735 aa  109  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  35.65 
 
 		 710 aa  108  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.44 
 
 		 716 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  22.5 
 
 		 778 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  22.42 
 
 		 777 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.46 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.13 
 
 		 732 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  37.61 
 
 		 717 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  30.53 
 
 		 795 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  23.11 
 
 		 776 aa  101  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  23.11 
 
 		 776 aa  101  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  27.8 
 
 		 755 aa  99.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  24.14 
 
 		 762 aa  99.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.16 
 
 		 746 aa  98.2  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>