170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0457 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  65.49 
 
 		 716 aa  834    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  65.36 
 
 		 717 aa  829    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  62.59 
 
 		 732 aa  759    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  58.6 
 
 		 728 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  64.1 
 
 		 715 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  58.19 
 
 		 764 aa  760    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 710 aa  1366    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  64.03 
 
 		 715 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  63.92 
 
 		 742 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.8 
 
 		 732 aa  323  9.000000000000001e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.89 
 
 		 733 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.34 
 
 		 741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  38.04 
 
 		 734 aa  312  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  34.69 
 
 		 742 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  36.29 
 
 		 735 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  35.5 
 
 		 759 aa  300  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.16 
 
 		 758 aa  295  1e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.51 
 
 		 742 aa  296  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.36 
 
 		 804 aa  292  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.52 
 
 		 758 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  35.48 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  36.4 
 
 		 759 aa  287  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  38.02 
 
 		 726 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  37.3 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  37.3 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  37.45 
 
 		 724 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.61 
 
 		 746 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  35.22 
 
 		 754 aa  273  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.93 
 
 		 786 aa  270  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  37.75 
 
 		 765 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.22 
 
 		 767 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.02 
 
 		 757 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.03 
 
 		 685 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.97 
 
 		 766 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.74 
 
 		 748 aa  257  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.85 
 
 		 813 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  34.52 
 
 		 829 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.35 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.01 
 
 		 795 aa  240  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.86 
 
 		 771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  33.5 
 
 		 874 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.72 
 
 		 788 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  35.41 
 
 		 705 aa  230  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.09 
 
 		 693 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  35.36 
 
 		 706 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.45 
 
 		 691 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.29 
 
 		 726 aa  218  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.99 
 
 		 659 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  32.28 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  33.96 
 
 		 703 aa  204  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.09 
 
 		 672 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  31.72 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  31.2 
 
 		 727 aa  187  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.89 
 
 		 645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.63 
 
 		 832 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  30.02 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  29.12 
 
 		 706 aa  173  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  29.32 
 
 		 679 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  38.02 
 
 		 902 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.95 
 
 		 695 aa  158  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.96 
 
 		 724 aa  157  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.02 
 
 		 705 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  43.27 
 
 		 666 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  32.79 
 
 		 680 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  34.85 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  37.5 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  40.33 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  40.26 
 
 		 684 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.91 
 
 		 670 aa  124  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.46 
 
 		 710 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  29.13 
 
 		 717 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  35.65 
 
 		 1048 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.5 
 
 		 861 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.69 
 
 		 755 aa  101  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.96 
 
 		 763 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.96 
 
 		 763 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  30.35 
 
 		 760 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  27.32 
 
 		 755 aa  99  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.86 
 
 		 706 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.86 
 
 		 706 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  31.56 
 
 		 712 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  23.22 
 
 		 689 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  22.71 
 
 		 753 aa  94.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  22.96 
 
 		 689 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  28.02 
 
 		 702 aa  94  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  22.96 
 
 		 689 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  22.02 
 
 		 691 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  22.96 
 
 		 689 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  28.31 
 
 		 689 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  28.31 
 
 		 689 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.08 
 
 		 691 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  29.38 
 
 		 689 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  26.52 
 
 		 762 aa  88.2  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  30.81 
 
 		 702 aa  87.8  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  29.38 
 
 		 691 aa  87.8  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  23.53 
 
 		 787 aa  87.4  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.7 
 
 		 777 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.7 
 
 		 776 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  24.7 
 
 		 777 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  24.7 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>