132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2150 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  57.66 
 
 		 776 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  57.26 
 
 		 754 aa  698    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.53 
 
 		 748 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 746 aa  1473    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.56 
 
 		 813 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.69 
 
 		 832 aa  618  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.03 
 
 		 766 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  48.55 
 
 		 795 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.39 
 
 		 786 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.77 
 
 		 804 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.97 
 
 		 788 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  47.15 
 
 		 771 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  49.73 
 
 		 765 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  45.45 
 
 		 734 aa  531  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.99 
 
 		 733 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  45.49 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  45.77 
 
 		 726 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  46.73 
 
 		 724 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  46.73 
 
 		 724 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  46.46 
 
 		 724 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  42.51 
 
 		 742 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  44.15 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.85 
 
 		 741 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  41.83 
 
 		 742 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.91 
 
 		 767 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.1 
 
 		 757 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.78 
 
 		 732 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  39.51 
 
 		 758 aa  460  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.93 
 
 		 685 aa  459  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  39.16 
 
 		 759 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.38 
 
 		 747 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  46.35 
 
 		 750 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  40.02 
 
 		 829 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.44 
 
 		 758 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  40.05 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.93 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  36.01 
 
 		 703 aa  340  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  36.16 
 
 		 799 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  36.24 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  36.77 
 
 		 761 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.53 
 
 		 705 aa  317  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  36.43 
 
 		 742 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.74 
 
 		 728 aa  314  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  49.24 
 
 		 902 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  36.11 
 
 		 726 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.08 
 
 		 715 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.71 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  37.33 
 
 		 716 aa  297  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.43 
 
 		 732 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  34.66 
 
 		 715 aa  292  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  35.62 
 
 		 717 aa  290  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35 
 
 		 693 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  36.58 
 
 		 710 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  34.84 
 
 		 706 aa  260  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.16 
 
 		 755 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  31.12 
 
 		 692 aa  236  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.37 
 
 		 724 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.28 
 
 		 659 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.73 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  35.41 
 
 		 680 aa  187  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.83 
 
 		 672 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  34.91 
 
 		 695 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  40.56 
 
 		 684 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  38.68 
 
 		 666 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.13 
 
 		 670 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  32.76 
 
 		 719 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.74 
 
 		 710 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  33.47 
 
 		 792 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  35.31 
 
 		 679 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.57 
 
 		 695 aa  167  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  33.73 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  40.59 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  28.31 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  26.99 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 691 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 691 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  38.89 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  41.59 
 
 		 706 aa  124  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  38.38 
 
 		 689 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.82 
 
 		 787 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  29.39 
 
 		 702 aa  114  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.51 
 
 		 861 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  33.68 
 
 		 755 aa  114  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.18 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.18 
 
 		 763 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  29.2 
 
 		 768 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  29.51 
 
 		 753 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.84 
 
 		 772 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  31.88 
 
 		 762 aa  104  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 780 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  32.82 
 
 		 785 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  34.27 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  36.16 
 
 		 1048 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.16 
 
 		 698 aa  101  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>