147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1829 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 706 aa  1368    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.27 
 
 		 732 aa  301  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  37.64 
 
 		 666 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  34.76 
 
 		 680 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.76 
 
 		 691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  33.38 
 
 		 799 aa  275  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  33.29 
 
 		 692 aa  267  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  29.5 
 
 		 758 aa  266  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.71 
 
 		 742 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.23 
 
 		 659 aa  260  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.08 
 
 		 767 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.82 
 
 		 672 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  36.01 
 
 		 717 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  32.01 
 
 		 742 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.94 
 
 		 645 aa  254  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  34.68 
 
 		 705 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  33.8 
 
 		 695 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.42 
 
 		 813 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  33.83 
 
 		 706 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  35.13 
 
 		 679 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.31 
 
 		 746 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.59 
 
 		 741 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.25 
 
 		 766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.61 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.79 
 
 		 724 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.57 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  32.27 
 
 		 719 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.74 
 
 		 832 aa  245  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  41.22 
 
 		 754 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  40.17 
 
 		 765 aa  244  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  34.93 
 
 		 750 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  33.33 
 
 		 726 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.58 
 
 		 748 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  38.97 
 
 		 759 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  33.28 
 
 		 727 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.72 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.95 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.33 
 
 		 695 aa  235  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  35.98 
 
 		 684 aa  233  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  39.41 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  39.67 
 
 		 776 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.19 
 
 		 670 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.23 
 
 		 747 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.27 
 
 		 734 aa  230  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  37.55 
 
 		 829 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.03 
 
 		 788 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  32.86 
 
 		 792 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.76 
 
 		 795 aa  227  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.92 
 
 		 685 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  32.65 
 
 		 761 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.98 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.98 
 
 		 724 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.94 
 
 		 804 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.77 
 
 		 724 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.78 
 
 		 693 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  34.23 
 
 		 759 aa  220  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  31.45 
 
 		 742 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  36.61 
 
 		 874 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.48 
 
 		 735 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.83 
 
 		 757 aa  210  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.8 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  35.66 
 
 		 771 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  30.95 
 
 		 716 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  33.63 
 
 		 703 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.58 
 
 		 861 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.08 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.03 
 
 		 715 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  29.44 
 
 		 717 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  29.19 
 
 		 1048 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  27.19 
 
 		 715 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.64 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.5 
 
 		 763 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  28.13 
 
 		 710 aa  164  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.26 
 
 		 691 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  25.04 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  25.04 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.89 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.63 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.87 
 
 		 728 aa  151  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  27.06 
 
 		 691 aa  151  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.35 
 
 		 689 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.97 
 
 		 755 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  25.07 
 
 		 691 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.86 
 
 		 732 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  25.18 
 
 		 689 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  23.93 
 
 		 778 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  24.13 
 
 		 776 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.15 
 
 		 776 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  24.18 
 
 		 777 aa  137  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  29.77 
 
 		 706 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.7 
 
 		 706 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.4 
 
 		 768 aa  127  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  35.83 
 
 		 755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  36.82 
 
 		 689 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.42 
 
 		 777 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.88 
 
 		 777 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  34.88 
 
 		 776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  34.88 
 
 		 776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  34.88 
 
 		 778 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  24.23 
 
 		 762 aa  117  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>