130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5043 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 685 aa  1337    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  51.62 
 
 		 735 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  51.27 
 
 		 734 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.35 
 
 		 733 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  50.85 
 
 		 724 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  51 
 
 		 724 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  51 
 
 		 724 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.55 
 
 		 813 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.78 
 
 		 766 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.79 
 
 		 748 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.81 
 
 		 786 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.04 
 
 		 746 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  45.22 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  42.6 
 
 		 795 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.86 
 
 		 832 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  45.88 
 
 		 754 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  44.78 
 
 		 759 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  42.61 
 
 		 771 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  45.14 
 
 		 776 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.95 
 
 		 788 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.1 
 
 		 804 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.65 
 
 		 747 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.03 
 
 		 767 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  39.7 
 
 		 742 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  39.35 
 
 		 742 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  41.7 
 
 		 874 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  42.65 
 
 		 726 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  46.74 
 
 		 750 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  43.38 
 
 		 829 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.64 
 
 		 741 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.81 
 
 		 758 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.53 
 
 		 732 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.69 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  34.82 
 
 		 758 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  36.22 
 
 		 759 aa  348  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.76 
 
 		 693 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  37.29 
 
 		 717 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  38.23 
 
 		 716 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.18 
 
 		 732 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  36.35 
 
 		 742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.8 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  34.67 
 
 		 715 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.71 
 
 		 764 aa  277  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.8 
 
 		 715 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.75 
 
 		 728 aa  261  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  36.97 
 
 		 710 aa  260  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  35.6 
 
 		 705 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.61 
 
 		 706 aa  236  9e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  44.85 
 
 		 902 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.66 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.53 
 
 		 724 aa  217  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  29.66 
 
 		 719 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  42.32 
 
 		 799 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.91 
 
 		 672 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.32 
 
 		 680 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.29 
 
 		 761 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.87 
 
 		 710 aa  200  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  30.74 
 
 		 692 aa  197  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  41.16 
 
 		 706 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  32.29 
 
 		 666 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.64 
 
 		 659 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  30.22 
 
 		 695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.33 
 
 		 695 aa  187  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  33.11 
 
 		 792 aa  185  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.97 
 
 		 645 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  32.77 
 
 		 684 aa  174  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  28.99 
 
 		 727 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  38.24 
 
 		 679 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  43.17 
 
 		 703 aa  167  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.77 
 
 		 670 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.7 
 
 		 1048 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  27.89 
 
 		 753 aa  137  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  28.95 
 
 		 717 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.76 
 
 		 763 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.46 
 
 		 755 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  31.84 
 
 		 780 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  32.03 
 
 		 787 aa  125  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  35.85 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  35.85 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.97 
 
 		 772 aa  122  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.69 
 
 		 689 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  35.5 
 
 		 702 aa  120  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 764 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.18 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.24 
 
 		 768 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.88 
 
 		 755 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  32.07 
 
 		 762 aa  118  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.16 
 
 		 716 aa  117  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  37.76 
 
 		 785 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.79 
 
 		 698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  33.33 
 
 		 778 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  30.33 
 
 		 702 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>