147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7576 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  54.43 
 
 		 776 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  54.68 
 
 		 754 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.06 
 
 		 748 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1548    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.51 
 
 		 813 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.28 
 
 		 832 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.89 
 
 		 786 aa  629  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.55 
 
 		 746 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  47.48 
 
 		 902 aa  621  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  50.57 
 
 		 765 aa  601  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.67 
 
 		 766 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.8 
 
 		 804 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.83 
 
 		 788 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  44.36 
 
 		 742 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  45.99 
 
 		 759 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  43.73 
 
 		 742 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  45.78 
 
 		 771 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.36 
 
 		 741 aa  539  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.62 
 
 		 767 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  42.98 
 
 		 735 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.77 
 
 		 733 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  43.41 
 
 		 734 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.52 
 
 		 747 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  46.06 
 
 		 726 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  43.13 
 
 		 724 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  43.13 
 
 		 724 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  43 
 
 		 724 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  42.67 
 
 		 829 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.61 
 
 		 757 aa  496  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  43.29 
 
 		 874 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  38.25 
 
 		 758 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.29 
 
 		 758 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  38.59 
 
 		 759 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  44.29 
 
 		 750 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.19 
 
 		 685 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.52 
 
 		 732 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  40.48 
 
 		 703 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.25 
 
 		 693 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  36.01 
 
 		 799 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.78 
 
 		 691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  38.09 
 
 		 726 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  36.9 
 
 		 705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  35.79 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.45 
 
 		 705 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  34.99 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  33.84 
 
 		 717 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.65 
 
 		 764 aa  279  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.06 
 
 		 742 aa  276  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.2 
 
 		 715 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  43.56 
 
 		 706 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  32.28 
 
 		 715 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.25 
 
 		 732 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  35.08 
 
 		 710 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.53 
 
 		 724 aa  236  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  35.74 
 
 		 706 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.78 
 
 		 728 aa  235  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.47 
 
 		 659 aa  205  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  31.15 
 
 		 717 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  35.53 
 
 		 692 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  35.31 
 
 		 695 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  32.14 
 
 		 719 aa  190  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  33.74 
 
 		 680 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  44.53 
 
 		 679 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.49 
 
 		 666 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.15 
 
 		 672 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.4 
 
 		 755 aa  184  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.76 
 
 		 695 aa  184  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.84 
 
 		 645 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.57 
 
 		 670 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  40.97 
 
 		 684 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.75 
 
 		 710 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  34.48 
 
 		 792 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  32.83 
 
 		 727 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  37.74 
 
 		 706 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  37.74 
 
 		 706 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 691 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 689 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  28.62 
 
 		 755 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  36.68 
 
 		 689 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  36.11 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.56 
 
 		 776 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.56 
 
 		 777 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  35.02 
 
 		 778 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.56 
 
 		 777 aa  118  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  34.56 
 
 		 776 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  34.56 
 
 		 776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  34.56 
 
 		 776 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.61 
 
 		 861 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  33.01 
 
 		 702 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.07 
 
 		 763 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.81 
 
 		 1048 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  34.56 
 
 		 778 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  34.1 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>