139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1900 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 724 aa  1389    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  40.08 
 
 		 703 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.5 
 
 		 693 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.44 
 
 		 741 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.11 
 
 		 742 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.41 
 
 		 759 aa  273  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.59 
 
 		 732 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  31.79 
 
 		 758 aa  269  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.55 
 
 		 691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  31.93 
 
 		 706 aa  251  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.44 
 
 		 666 aa  246  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.8 
 
 		 832 aa  240  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.37 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.64 
 
 		 766 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.48 
 
 		 659 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.11 
 
 		 710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.82 
 
 		 813 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.38 
 
 		 733 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.58 
 
 		 705 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  36.5 
 
 		 792 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.92 
 
 		 645 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  37.22 
 
 		 742 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.72 
 
 		 715 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  42.81 
 
 		 759 aa  220  8.999999999999998e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  37.63 
 
 		 734 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  34.83 
 
 		 716 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  40.57 
 
 		 795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.94 
 
 		 788 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  41.9 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  38.14 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  38.35 
 
 		 724 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  38.35 
 
 		 724 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  42.86 
 
 		 902 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  33.29 
 
 		 679 aa  210  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.26 
 
 		 717 aa  210  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.37 
 
 		 804 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.9 
 
 		 672 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  38.55 
 
 		 829 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  32.77 
 
 		 727 aa  208  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.24 
 
 		 685 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.93 
 
 		 747 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.21 
 
 		 735 aa  205  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.49 
 
 		 670 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  31.22 
 
 		 719 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.95 
 
 		 748 aa  200  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.17 
 
 		 680 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  31.36 
 
 		 715 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  38.43 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.37 
 
 		 757 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  31.22 
 
 		 692 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.82 
 
 		 767 aa  195  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.45 
 
 		 695 aa  195  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  40.05 
 
 		 706 aa  194  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  34.02 
 
 		 684 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.6 
 
 		 754 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  40.33 
 
 		 799 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  38.32 
 
 		 750 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.76 
 
 		 695 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  30.51 
 
 		 1048 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  40.77 
 
 		 705 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  37.97 
 
 		 776 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  37.43 
 
 		 874 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.89 
 
 		 861 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  25.07 
 
 		 689 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.75 
 
 		 758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.5 
 
 		 691 aa  173  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.59 
 
 		 691 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.42 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.64 
 
 		 689 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.64 
 
 		 689 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  41.21 
 
 		 726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.34 
 
 		 689 aa  167  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  39.05 
 
 		 742 aa  167  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.56 
 
 		 689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  25.41 
 
 		 691 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  35.98 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.42 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.26 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  48.97 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.26 
 
 		 763 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  23.82 
 
 		 760 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  42.23 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 728 aa  147  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.48 
 
 		 755 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  23.87 
 
 		 777 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  23.13 
 
 		 776 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  23.38 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  23.18 
 
 		 778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.25 
 
 		 776 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  22.99 
 
 		 777 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  23.27 
 
 		 776 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  23.27 
 
 		 776 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  22.01 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  34.11 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  30.6 
 
 		 689 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  34.11 
 
 		 706 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  32.52 
 
 		 689 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.72 
 
 		 772 aa  114  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.76 
 
 		 786 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>