131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  56.57 
 
 		 684 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  53.23 
 
 		 719 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 695 aa  1351    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  55.02 
 
 		 659 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.44 
 
 		 672 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  50.21 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  47.84 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  50.15 
 
 		 717 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.87 
 
 		 645 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  47.83 
 
 		 692 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  47.85 
 
 		 695 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  47.41 
 
 		 727 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  48.27 
 
 		 679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  45.59 
 
 		 792 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46 
 
 		 670 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.68 
 
 		 710 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  34.08 
 
 		 1048 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  30.76 
 
 		 742 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.43 
 
 		 706 aa  246  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.26 
 
 		 705 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.18 
 
 		 861 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.52 
 
 		 706 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.81 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.4 
 
 		 693 aa  222  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  31.87 
 
 		 726 aa  221  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  28.55 
 
 		 742 aa  220  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  32.98 
 
 		 705 aa  220  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.45 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  27.68 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.51 
 
 		 703 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.29 
 
 		 766 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.07 
 
 		 747 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.99 
 
 		 741 aa  197  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  31.09 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  37.29 
 
 		 750 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.36 
 
 		 813 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.74 
 
 		 732 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.45 
 
 		 724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.21 
 
 		 757 aa  190  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.73 
 
 		 759 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  34.54 
 
 		 874 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.17 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  38.35 
 
 		 776 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.81 
 
 		 788 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.56 
 
 		 748 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.07 
 
 		 726 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  34.17 
 
 		 771 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  39.1 
 
 		 799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.25 
 
 		 767 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.28 
 
 		 735 aa  180  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  32.7 
 
 		 734 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  34.54 
 
 		 829 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.05 
 
 		 733 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  37.09 
 
 		 754 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  33.33 
 
 		 759 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  26.71 
 
 		 702 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.04 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  34.62 
 
 		 765 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.26 
 
 		 786 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.69 
 
 		 746 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.51 
 
 		 763 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.31 
 
 		 795 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.86 
 
 		 764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  24.01 
 
 		 760 aa  164  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.85 
 
 		 685 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  34.41 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  34.41 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  36.01 
 
 		 716 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.41 
 
 		 724 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  23.12 
 
 		 689 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  23.12 
 
 		 689 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  29.16 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  22.67 
 
 		 689 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  23.77 
 
 		 691 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  22.97 
 
 		 691 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24 
 
 		 691 aa  156  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  23.77 
 
 		 706 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  23.77 
 
 		 706 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.18 
 
 		 832 aa  156  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  23.46 
 
 		 689 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  22.37 
 
 		 689 aa  154  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.28 
 
 		 728 aa  153  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  22.67 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  33.58 
 
 		 742 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  22.82 
 
 		 689 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  22.5 
 
 		 702 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.59 
 
 		 732 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.18 
 
 		 715 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  34.23 
 
 		 710 aa  140  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  33.22 
 
 		 902 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  30.62 
 
 		 715 aa  137  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  23.87 
 
 		 764 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  32.73 
 
 		 755 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.16 
 
 		 755 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  23.03 
 
 		 762 aa  127  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  34.3 
 
 		 787 aa  124  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  23.61 
 
 		 753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  32.57 
 
 		 768 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.25 
 
 		 772 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.41 
 
 		 780 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>