141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2694 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  57.02 
 
 
695 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  57.48 
 
 
680 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  66.62 
 
 
692 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.97 
 
 
645 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  100 
 
 
679 aa  1320    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.3 
 
 
670 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.58 
 
 
672 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.24 
 
 
659 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  51.19 
 
 
666 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  45.43 
 
 
719 aa  515  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.65 
 
 
695 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  48.78 
 
 
717 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  45.93 
 
 
727 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  44.51 
 
 
792 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  49.2 
 
 
684 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.82 
 
 
710 aa  336  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.84 
 
 
813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  34.51 
 
 
1048 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  35.29 
 
 
706 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.62 
 
 
861 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.2 
 
 
691 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.43 
 
 
767 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.52 
 
 
705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  30.54 
 
 
759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.47 
 
 
799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.34 
 
 
786 aa  233  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.39 
 
 
732 aa  232  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.82 
 
 
746 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  30.85 
 
 
742 aa  227  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  33.38 
 
 
726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  30.66 
 
 
758 aa  224  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.13 
 
 
724 aa  223  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.42 
 
 
706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  29.77 
 
 
726 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  33.1 
 
 
705 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  30.95 
 
 
742 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.63 
 
 
741 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.86 
 
 
747 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  30.91 
 
 
703 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  32.63 
 
 
761 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  37.05 
 
 
759 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.75 
 
 
766 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.58 
 
 
735 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.34 
 
 
734 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.2 
 
 
733 aa  184  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  38.31 
 
 
776 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  37.56 
 
 
750 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  36.96 
 
 
754 aa  180  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  24.63 
 
 
706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  34.59 
 
 
771 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  25.26 
 
 
689 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  24.92 
 
 
691 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  44.53 
 
 
795 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.23 
 
 
755 aa  173  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  24.48 
 
 
706 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.34 
 
 
748 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.56 
 
 
724 aa  170  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  34.77 
 
 
724 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  34.77 
 
 
724 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.47 
 
 
788 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.25 
 
 
758 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  33.47 
 
 
874 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.66 
 
 
685 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.07 
 
 
757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.96 
 
 
804 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  38.87 
 
 
829 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.58 
 
 
763 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.37 
 
 
832 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.91 
 
 
693 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.56 
 
 
715 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  35.31 
 
 
765 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  29.34 
 
 
716 aa  147  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  23.93 
 
 
702 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  27.72 
 
 
715 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  37.88 
 
 
902 aa  143  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  24.02 
 
 
768 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  24.96 
 
 
764 aa  140  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  37.6 
 
 
742 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.11 
 
 
768 aa  133  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  23.89 
 
 
748 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.95 
 
 
689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  38.14 
 
 
689 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  38.14 
 
 
689 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  38.14 
 
 
689 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  38.14 
 
 
689 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  37.63 
 
 
691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  37.63 
 
 
689 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  36.07 
 
 
753 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.03 
 
 
732 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  37.11 
 
 
691 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.57 
 
 
772 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.16 
 
 
764 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.3 
 
 
716 aa  123  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.34 
 
 
755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  34.98 
 
 
778 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  35.02 
 
 
776 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  35.02 
 
 
777 aa  120  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  35.47 
 
 
776 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  35.47 
 
 
776 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  31.37 
 
 
702 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>