134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8108 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 719 aa  1429    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.16 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.58 
 
 		 695 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.28 
 
 		 672 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  49.36 
 
 		 695 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  48.87 
 
 		 680 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  49.51 
 
 		 717 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  48.34 
 
 		 666 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.72 
 
 		 670 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  52.71 
 
 		 684 aa  565  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.52 
 
 		 645 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  47.08 
 
 		 727 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  45.75 
 
 		 792 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  46.48 
 
 		 692 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  45.57 
 
 		 679 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.25 
 
 		 710 aa  324  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  33.79 
 
 		 1048 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  32.85 
 
 		 706 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.62 
 
 		 813 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.39 
 
 		 861 aa  250  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  31.68 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.62 
 
 		 732 aa  243  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  31.55 
 
 		 706 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.79 
 
 		 788 aa  237  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.39 
 
 		 693 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.71 
 
 		 691 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.89 
 
 		 705 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  31.21 
 
 		 703 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.42 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.56 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  29.07 
 
 		 758 aa  208  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.41 
 
 		 734 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  44.88 
 
 		 799 aa  204  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  36.88 
 
 		 759 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  36.55 
 
 		 874 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  36.29 
 
 		 735 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.77 
 
 		 766 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.13 
 
 		 757 aa  194  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.85 
 
 		 726 aa  194  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.12 
 
 		 829 aa  190  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  33.27 
 
 		 742 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  34.31 
 
 		 754 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  34.44 
 
 		 776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  32.38 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.94 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.05 
 
 		 771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  36.13 
 
 		 759 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  35.96 
 
 		 750 aa  181  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  35.43 
 
 		 726 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.76 
 
 		 746 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  32.14 
 
 		 795 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.52 
 
 		 733 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.04 
 
 		 764 aa  177  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.63 
 
 		 691 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.8 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.74 
 
 		 691 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.51 
 
 		 689 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  26.18 
 
 		 691 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.25 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.4 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.25 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  34.65 
 
 		 724 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.79 
 
 		 763 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  34.65 
 
 		 724 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.68 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.84 
 
 		 767 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.18 
 
 		 689 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.95 
 
 		 804 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.69 
 
 		 689 aa  170  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  33.03 
 
 		 765 aa  170  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.66 
 
 		 786 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.16 
 
 		 758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.26 
 
 		 832 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.67 
 
 		 702 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  25.81 
 
 		 689 aa  167  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  25.2 
 
 		 776 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  25.2 
 
 		 776 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  38.69 
 
 		 902 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.06 
 
 		 761 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.32 
 
 		 715 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.5 
 
 		 685 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.36 
 
 		 753 aa  154  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.49 
 
 		 747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  40.49 
 
 		 742 aa  147  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.02 
 
 		 755 aa  145  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.28 
 
 		 732 aa  140  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  32.46 
 
 		 716 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  31.72 
 
 		 717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  43.65 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  30.84 
 
 		 715 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  29.78 
 
 		 778 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  29.88 
 
 		 777 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  35.71 
 
 		 706 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  35.71 
 
 		 706 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.56 
 
 		 755 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  29.88 
 
 		 778 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  30.18 
 
 		 776 aa  124  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.99 
 
 		 777 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  33.91 
 
 		 712 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  33.2 
 
 		 768 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>