135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4146 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 717 aa  1397    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.17 
 
 		 659 aa  598  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  48.72 
 
 		 719 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.35 
 
 		 672 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  49.18 
 
 		 727 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  50.21 
 
 		 666 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.37 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  47.68 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  50 
 
 		 695 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  49.65 
 
 		 684 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  47.34 
 
 		 695 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  46.25 
 
 		 792 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.81 
 
 		 670 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  46.12 
 
 		 692 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  47.7 
 
 		 679 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.63 
 
 		 710 aa  326  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.57 
 
 		 741 aa  267  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  36.01 
 
 		 706 aa  265  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  33.03 
 
 		 1048 aa  256  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.33 
 
 		 733 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.21 
 
 		 759 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.82 
 
 		 861 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  32.95 
 
 		 742 aa  243  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  31.09 
 
 		 734 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  30.8 
 
 		 735 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  29.17 
 
 		 758 aa  222  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  33.1 
 
 		 726 aa  221  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.68 
 
 		 747 aa  220  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.26 
 
 		 724 aa  219  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.45 
 
 		 732 aa  219  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.87 
 
 		 758 aa  217  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.77 
 
 		 691 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  31.38 
 
 		 742 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.84 
 
 		 693 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  33.16 
 
 		 705 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  25.47 
 
 		 691 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.57 
 
 		 691 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  25.78 
 
 		 689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.83 
 
 		 689 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  25.48 
 
 		 689 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  25.48 
 
 		 689 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.68 
 
 		 766 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  25.2 
 
 		 691 aa  193  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.54 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  25.04 
 
 		 689 aa  190  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  30.09 
 
 		 799 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  24.59 
 
 		 689 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.1 
 
 		 702 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 750 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.31 
 
 		 813 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  28.42 
 
 		 759 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.29 
 
 		 689 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.1 
 
 		 757 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.89 
 
 		 726 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.3 
 
 		 763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  34.89 
 
 		 776 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  35.04 
 
 		 765 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.96 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.34 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  35.4 
 
 		 754 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.96 
 
 		 755 aa  161  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.35 
 
 		 804 aa  160  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.96 
 
 		 764 aa  157  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  32.41 
 
 		 795 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.26 
 
 		 788 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.47 
 
 		 786 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  32.71 
 
 		 771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  28.4 
 
 		 717 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.63 
 
 		 748 aa  154  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  31.65 
 
 		 829 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.98 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  29.2 
 
 		 724 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  28.77 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  28.77 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  33.79 
 
 		 761 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.47 
 
 		 874 aa  144  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  27.27 
 
 		 715 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.1 
 
 		 728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  22.27 
 
 		 703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  22.86 
 
 		 702 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.89 
 
 		 753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.67 
 
 		 706 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.15 
 
 		 685 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.6 
 
 		 742 aa  139  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  37.68 
 
 		 902 aa  137  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.35 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.61 
 
 		 716 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  33.63 
 
 		 755 aa  124  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  40.78 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.97 
 
 		 698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.17 
 
 		 763 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 778 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  35.25 
 
 		 777 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  34.54 
 
 		 778 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  32.65 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.84 
 
 		 777 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.43 
 
 		 777 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  34.84 
 
 		 776 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  34.84 
 
 		 776 aa  118  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.43 
 
 		 776 aa  118  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>