135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2598 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  71.45 
 
 
724 aa  949    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  71.45 
 
 
724 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  100 
 
 
734 aa  1457    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  71.17 
 
 
724 aa  948    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  85.03 
 
 
735 aa  1232    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  68.09 
 
 
733 aa  939    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.63 
 
 
813 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.21 
 
 
685 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.09 
 
 
748 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  46.72 
 
 
765 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  45.84 
 
 
776 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.57 
 
 
766 aa  522  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.45 
 
 
746 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  46.63 
 
 
754 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.55 
 
 
832 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  43.16 
 
 
795 aa  499  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  43.99 
 
 
759 aa  485  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.2 
 
 
786 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.86 
 
 
804 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.37 
 
 
767 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  42.41 
 
 
771 aa  462  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.09 
 
 
788 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  39.02 
 
 
742 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  38.68 
 
 
742 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.16 
 
 
741 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  40.73 
 
 
874 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.42 
 
 
758 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  39.05 
 
 
829 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.92 
 
 
747 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.39 
 
 
757 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  36.84 
 
 
758 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  40.08 
 
 
726 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.25 
 
 
732 aa  399  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  37.39 
 
 
759 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  44.23 
 
 
750 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.21 
 
 
693 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  36.07 
 
 
799 aa  330  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.89 
 
 
715 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.16 
 
 
764 aa  326  9e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  37.52 
 
 
717 aa  318  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  37.45 
 
 
716 aa  317  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  37.32 
 
 
715 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.31 
 
 
732 aa  312  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.6 
 
 
742 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.99 
 
 
691 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.22 
 
 
728 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  36.94 
 
 
703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  37.38 
 
 
706 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  37.5 
 
 
705 aa  300  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  38.09 
 
 
710 aa  296  7e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  34.16 
 
 
726 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.37 
 
 
705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  46.29 
 
 
902 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.74 
 
 
645 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  35.81 
 
 
761 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.61 
 
 
692 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.18 
 
 
755 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  31.74 
 
 
717 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  35.27 
 
 
706 aa  230  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  31.4 
 
 
727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  32.96 
 
 
666 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.91 
 
 
724 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.59 
 
 
659 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  33.4 
 
 
695 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.59 
 
 
861 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  35.78 
 
 
719 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.54 
 
 
670 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  33.82 
 
 
680 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.81 
 
 
672 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.82 
 
 
695 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.16 
 
 
679 aa  177  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  44.87 
 
 
684 aa  167  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.08 
 
 
710 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  33.61 
 
 
792 aa  161  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.67 
 
 
691 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.57 
 
 
1048 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  27.68 
 
 
689 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.68 
 
 
689 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.68 
 
 
689 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  34.68 
 
 
689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.5 
 
 
689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.68 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.5 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.68 
 
 
689 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.76 
 
 
706 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.76 
 
 
706 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.06 
 
 
689 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  28.95 
 
 
755 aa  118  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.94 
 
 
753 aa  111  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  30.03 
 
 
787 aa  110  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.1 
 
 
763 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.34 
 
 
716 aa  110  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  29.77 
 
 
764 aa  110  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.69 
 
 
763 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  29.3 
 
 
702 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.76 
 
 
698 aa  109  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.22 
 
 
772 aa  108  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  37.88 
 
 
712 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  31.85 
 
 
762 aa  107  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.07 
 
 
736 aa  106  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>