147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3352 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  58.47 
 
 		 728 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  86.27 
 
 		 715 aa  1224    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  74.02 
 
 		 717 aa  1032    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  72.15 
 
 		 732 aa  968    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  80 
 
 		 716 aa  1128    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 715 aa  1432    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  60.53 
 
 		 764 aa  869    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  64.1 
 
 		 710 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  72.06 
 
 		 742 aa  1053    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.68 
 
 		 733 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  36.14 
 
 		 735 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.96 
 
 		 742 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.06 
 
 		 734 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.01 
 
 		 732 aa  306  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.51 
 
 		 724 aa  303  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.52 
 
 		 724 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.52 
 
 		 724 aa  303  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.41 
 
 		 741 aa  302  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.97 
 
 		 748 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.98 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34 
 
 		 766 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  33.78 
 
 		 759 aa  290  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  33.69 
 
 		 759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.55 
 
 		 813 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  32.38 
 
 		 742 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.78 
 
 		 758 aa  283  9e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.29 
 
 		 804 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.32 
 
 		 746 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  34.83 
 
 		 776 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.92 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  34.94 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  32.82 
 
 		 754 aa  273  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.58 
 
 		 767 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.38 
 
 		 685 aa  267  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.04 
 
 		 786 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.69 
 
 		 757 aa  262  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.09 
 
 		 832 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.77 
 
 		 771 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 		 750 aa  249  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.74 
 
 		 829 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.93 
 
 		 788 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.79 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  31 
 
 		 747 aa  243  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  32.03 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  32.03 
 
 		 795 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  31.1 
 
 		 703 aa  224  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  30.49 
 
 		 726 aa  220  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.59 
 
 		 693 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.12 
 
 		 724 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  31.68 
 
 		 705 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  29.51 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.82 
 
 		 659 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.56 
 
 		 705 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  29.86 
 
 		 761 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.89 
 
 		 672 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  27.19 
 
 		 706 aa  180  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  27.96 
 
 		 727 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.2 
 
 		 710 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.58 
 
 		 755 aa  176  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  37.81 
 
 		 902 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  41.64 
 
 		 799 aa  170  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  28.77 
 
 		 692 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  25.73 
 
 		 680 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.68 
 
 		 645 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  29.93 
 
 		 792 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.54 
 
 		 670 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  28.18 
 
 		 717 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  29.51 
 
 		 684 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.46 
 
 		 695 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  25.68 
 
 		 695 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  30.54 
 
 		 719 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  26.05 
 
 		 679 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  37.61 
 
 		 666 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.61 
 
 		 763 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.11 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  22.81 
 
 		 706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  22.9 
 
 		 706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.53 
 
 		 861 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  21.4 
 
 		 691 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  20.85 
 
 		 691 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  21.34 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  21.34 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  21.34 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  21.34 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  20.88 
 
 		 691 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.64 
 
 		 1048 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  20.95 
 
 		 689 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.44 
 
 		 755 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  20.95 
 
 		 689 aa  104  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  34.03 
 
 		 748 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 780 aa  103  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.12 
 
 		 706 aa  100  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  29.82 
 
 		 753 aa  98.6  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  29.61 
 
 		 760 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  31.56 
 
 		 768 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.52 
 
 		 716 aa  96.3  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  30.77 
 
 		 778 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.77 
 
 		 698 aa  96.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 778 aa  95.1  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  32.49 
 
 		 712 aa  94.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>