145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4077 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  55.17 
 
 		 692 aa  699    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.63 
 
 		 645 aa  711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  100 
 
 		 695 aa  1361    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  87.39 
 
 		 680 aa  1162    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  57.02 
 
 		 679 aa  675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  61.1 
 
 		 670 aa  745    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.49 
 
 		 659 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.82 
 
 		 672 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  49.36 
 
 		 719 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  52.96 
 
 		 666 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  46.81 
 
 		 727 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.24 
 
 		 695 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  45.14 
 
 		 792 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  46.64 
 
 		 684 aa  495  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  48.33 
 
 		 717 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.85 
 
 		 710 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  34.87 
 
 		 1048 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.95 
 
 		 706 aa  261  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.9 
 
 		 813 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.87 
 
 		 732 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  30.39 
 
 		 759 aa  233  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  30.59 
 
 		 742 aa  226  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  32.51 
 
 		 705 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.75 
 
 		 741 aa  224  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.57 
 
 		 726 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.13 
 
 		 706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.41 
 
 		 861 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.61 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  32.35 
 
 		 724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  32.35 
 
 		 724 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  32.35 
 
 		 724 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  28.78 
 
 		 758 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.07 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  30.85 
 
 		 742 aa  208  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.93 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.57 
 
 		 724 aa  200  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  33.4 
 
 		 734 aa  197  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.66 
 
 		 874 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  27.13 
 
 		 691 aa  193  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  37.8 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.4 
 
 		 733 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  36.74 
 
 		 754 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  27.39 
 
 		 689 aa  190  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.26 
 
 		 689 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.26 
 
 		 689 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  39.16 
 
 		 776 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  38.76 
 
 		 759 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.52 
 
 		 689 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  27.25 
 
 		 689 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  26.32 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.83 
 
 		 771 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  26.64 
 
 		 691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.32 
 
 		 766 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.23 
 
 		 767 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.91 
 
 		 746 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.41 
 
 		 788 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.68 
 
 		 757 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.83 
 
 		 689 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.35 
 
 		 804 aa  180  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.31 
 
 		 795 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.74 
 
 		 689 aa  177  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.48 
 
 		 763 aa  177  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  42.19 
 
 		 799 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  39.05 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  32.64 
 
 		 735 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  27.53 
 
 		 702 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.19 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  37.03 
 
 		 750 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.96 
 
 		 829 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.17 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.26 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.11 
 
 		 685 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.01 
 
 		 832 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  34.49 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.18 
 
 		 716 aa  156  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  28.12 
 
 		 717 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  39.32 
 
 		 902 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.11 
 
 		 693 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.6 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  25.34 
 
 		 702 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.24 
 
 		 715 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  42 
 
 		 703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.78 
 
 		 732 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  37.39 
 
 		 742 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  25.45 
 
 		 715 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  24.24 
 
 		 748 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  25.96 
 
 		 762 aa  131  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  38.03 
 
 		 712 aa  130  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.65 
 
 		 768 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  35.87 
 
 		 778 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  32.4 
 
 		 706 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  32.4 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  40.33 
 
 		 710 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  35.87 
 
 		 776 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  35.87 
 
 		 777 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 778 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  29.29 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  35.87 
 
 		 777 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  36.36 
 
 		 777 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  36.36 
 
 		 776 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>