189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1963 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  100 
 
 		 748 aa  1535    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  41.23 
 
 		 753 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 780 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  31.52 
 
 		 778 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.08 
 
 		 776 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  31.18 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  30.82 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.95 
 
 		 777 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  30.82 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  29.95 
 
 		 778 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  31.18 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  30.34 
 
 		 776 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  31.32 
 
 		 768 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  31.39 
 
 		 702 aa  325  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  31.07 
 
 		 785 aa  316  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  28.81 
 
 		 760 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.52 
 
 		 768 aa  309  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  29.84 
 
 		 762 aa  298  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.85 
 
 		 772 aa  290  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  28.88 
 
 		 764 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  30.63 
 
 		 689 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  30.63 
 
 		 689 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  30.48 
 
 		 689 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  30.34 
 
 		 689 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  31.59 
 
 		 691 aa  283  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  30.81 
 
 		 689 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  31.4 
 
 		 691 aa  281  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  28.92 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  31.07 
 
 		 691 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  30.06 
 
 		 689 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  28.77 
 
 		 706 aa  275  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.21 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  29.43 
 
 		 755 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.89 
 
 		 763 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  29.78 
 
 		 689 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  27.51 
 
 		 703 aa  253  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.26 
 
 		 706 aa  220  7.999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.13 
 
 		 698 aa  214  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.35 
 
 		 716 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  46.27 
 
 		 702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  28.41 
 
 		 712 aa  200  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  25.73 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.9 
 
 		 787 aa  181  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  34.12 
 
 		 269 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.22 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.58 
 
 		 736 aa  139  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.93 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.46 
 
 		 659 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  23.58 
 
 		 692 aa  134  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.29 
 
 		 670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  23.43 
 
 		 792 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  23.74 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  24.38 
 
 		 727 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  24.02 
 
 		 684 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.11 
 
 		 710 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 717 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  32.64 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  25.76 
 
 		 852 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.7 
 
 		 695 aa  112  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  30.77 
 
 		 679 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.07 
 
 		 733 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  22.09 
 
 		 1048 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.06 
 
 		 767 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.05 
 
 		 741 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  32.34 
 
 		 742 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.35 
 
 		 804 aa  107  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  30.12 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  33.84 
 
 		 716 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.72 
 
 		 715 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.88 
 
 		 757 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.48 
 
 		 685 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  33.19 
 
 		 719 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  33.03 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  23.12 
 
 		 706 aa  103  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  32.88 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  32.38 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.33 
 
 		 764 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  32.39 
 
 		 829 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  32.43 
 
 		 724 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  34.04 
 
 		 742 aa  101  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  29.43 
 
 		 799 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  34.82 
 
 		 742 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  32.05 
 
 		 724 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  32.05 
 
 		 724 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  34.83 
 
 		 734 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  35.68 
 
 		 680 aa  100  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  29.41 
 
 		 771 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.92 
 
 		 813 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  30.66 
 
 		 765 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.99 
 
 		 732 aa  99.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  34.15 
 
 		 735 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.01 
 
 		 766 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  34.95 
 
 		 715 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.26 
 
 		 832 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  32.98 
 
 		 717 aa  96.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.58 
 
 		 732 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.43 
 
 		 759 aa  96.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  29.01 
 
 		 902 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  30.36 
 
 		 795 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  30.83 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>