145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1592 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  56.41 
 
 		 786 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1516    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.92 
 
 		 746 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  90.7 
 
 		 754 aa  1261    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.04 
 
 		 766 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  55.2 
 
 		 832 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  60.16 
 
 		 748 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  54.43 
 
 		 795 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  57.09 
 
 		 813 aa  723    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  55.56 
 
 		 765 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  48.08 
 
 		 902 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.74 
 
 		 804 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.52 
 
 		 788 aa  595  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  50.7 
 
 		 759 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  49.67 
 
 		 771 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.21 
 
 		 741 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.68 
 
 		 733 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  47.82 
 
 		 724 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  47.82 
 
 		 724 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  47.69 
 
 		 724 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  45.41 
 
 		 742 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  46.5 
 
 		 734 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  49.6 
 
 		 726 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  44.65 
 
 		 742 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  46.04 
 
 		 735 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.72 
 
 		 757 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.98 
 
 		 767 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  43.94 
 
 		 829 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  53.04 
 
 		 750 aa  507  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  47.12 
 
 		 874 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.77 
 
 		 758 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  41.49 
 
 		 759 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.39 
 
 		 732 aa  485  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  40.18 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.5 
 
 		 747 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.03 
 
 		 685 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.22 
 
 		 693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  39.83 
 
 		 703 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.12 
 
 		 691 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  38.28 
 
 		 799 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  37.75 
 
 		 761 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  36.09 
 
 		 742 aa  330  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  36.95 
 
 		 716 aa  313  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.67 
 
 		 764 aa  312  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  36.96 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.84 
 
 		 732 aa  306  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.92 
 
 		 715 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  35.41 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  35.5 
 
 		 715 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  36.85 
 
 		 710 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.7 
 
 		 728 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.29 
 
 		 755 aa  266  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  33.82 
 
 		 680 aa  266  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  40.21 
 
 		 706 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  44.14 
 
 		 706 aa  250  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  42.19 
 
 		 705 aa  235  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.47 
 
 		 705 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.8 
 
 		 724 aa  219  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.58 
 
 		 659 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  42.13 
 
 		 666 aa  208  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.35 
 
 		 670 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  39.3 
 
 		 695 aa  202  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  34.23 
 
 		 719 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  36.5 
 
 		 692 aa  197  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.6 
 
 		 695 aa  194  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.94 
 
 		 672 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.46 
 
 		 645 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  36.3 
 
 		 717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  38.54 
 
 		 684 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  38.24 
 
 		 679 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  36.63 
 
 		 727 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  35.41 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.79 
 
 		 710 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.47 
 
 		 706 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.47 
 
 		 706 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  33.46 
 
 		 689 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  33.46 
 
 		 689 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  33.46 
 
 		 689 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  32.17 
 
 		 689 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  32.71 
 
 		 689 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  35.87 
 
 		 691 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  37.19 
 
 		 691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  31.95 
 
 		 689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  31.95 
 
 		 689 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  37.5 
 
 		 755 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  29.72 
 
 		 1048 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  35.96 
 
 		 753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  34.9 
 
 		 760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.93 
 
 		 763 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.35 
 
 		 772 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.93 
 
 		 763 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.09 
 
 		 861 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  33.17 
 
 		 702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  30.97 
 
 		 702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  36.73 
 
 		 787 aa  108  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  36.79 
 
 		 785 aa  108  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.59 
 
 		 716 aa  107  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  37.06 
 
 		 712 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  32.3 
 
 		 780 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>