More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2058 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  69.63 
 
 
526 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  82.92 
 
 
519 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  69.63 
 
 
526 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
521 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  69.23 
 
 
526 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  48.03 
 
 
525 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  46.25 
 
 
512 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  50.1 
 
 
519 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  41.79 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 
522 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
474 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
489 aa  223  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
448 aa  220  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
570 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
570 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
515 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
456 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
461 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
461 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  30.86 
 
 
460 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 
405 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 
424 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 
841 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  33.16 
 
 
431 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  34.26 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  41.51 
 
 
836 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  41.51 
 
 
792 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
471 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
571 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
718 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  35.89 
 
 
771 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
420 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.24 
 
 
1171 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
405 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
647 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
698 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
654 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
451 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
421 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 
513 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 
547 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  30.47 
 
 
415 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
439 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 
547 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
635 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
713 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 
508 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
647 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 
434 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
371 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
446 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
770 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
407 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.79 
 
 
491 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
636 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
574 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
389 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
384 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  33.52 
 
 
421 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
496 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
452 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 
343 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
430 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  38.06 
 
 
550 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
210 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0491  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
522 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.165576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
487 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
403 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
465 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  35.16 
 
 
760 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 
553 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  32.16 
 
 
334 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
196 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  36.31 
 
 
1301 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
334 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 
389 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
197 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
487 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 
481 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
539 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 
469 aa  100  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 
320 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  31.58 
 
 
334 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
1073 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  34.1 
 
 
561 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
710 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
367 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>