141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1703 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  100 
 
 
172 aa  340  7e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  51.43 
 
 
192 aa  155  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  50.29 
 
 
192 aa  153  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  50 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  47.16 
 
 
180 aa  148  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  45.71 
 
 
178 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  45.14 
 
 
176 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  46.29 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  44.85 
 
 
181 aa  137  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  42.77 
 
 
192 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  45.09 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  44.12 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  45.81 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  42.77 
 
 
181 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  41.14 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  40.94 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  42.86 
 
 
204 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  41.18 
 
 
184 aa  125  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  44.71 
 
 
184 aa  124  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  45.76 
 
 
178 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  45.2 
 
 
178 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  38.82 
 
 
187 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  45.2 
 
 
178 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  43.31 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  39.43 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  43.93 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  44.25 
 
 
174 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  37.5 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  40.38 
 
 
180 aa  111  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  37.75 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  36.02 
 
 
327 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  35.22 
 
 
327 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  30.43 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  25.82 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  31.85 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  30.66 
 
 
219 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  27.37 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  25.82 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  27.67 
 
 
222 aa  52  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  26.09 
 
 
233 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  25.7 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  28.86 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  25.99 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.94 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  28.57 
 
 
275 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  23.04 
 
 
514 aa  48.5  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  25.25 
 
 
212 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  31.78 
 
 
194 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  26.87 
 
 
212 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  30.94 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  26.71 
 
 
213 aa  47.8  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  28.1 
 
 
511 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  23.59 
 
 
201 aa  47.8  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  23.9 
 
 
221 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  30.46 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  25.77 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  30.34 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  30.89 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  25.84 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  26.23 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  30.34 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  27.45 
 
 
511 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  26.11 
 
 
227 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  28.14 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  25 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  28.02 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  25.57 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  27.22 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  43.64 
 
 
214 aa  45.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  26.21 
 
 
214 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  24.57 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  27.34 
 
 
212 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  28.24 
 
 
209 aa  44.3  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  51.28 
 
 
811 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  47.22 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  29.76 
 
 
227 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  25.47 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  33.82 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  24.46 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  28.29 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  29.85 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  27.67 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  26.44 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  44.74 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  24.6 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  24.19 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  50 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  33.9 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  29.55 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  30 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  29.55 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.68 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  39.58 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0403  cytidylate kinase  34.29 
 
 
213 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  52.78 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  24.59 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  21.98 
 
 
528 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  41.67 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  24.59 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  25.84 
 
 
240 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>