More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2916 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  407  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  59.15 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  50.95 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  48.39 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  48.79 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  51.17 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  51.44 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  50.7 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  51.47 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  48.08 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.3 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  47.72 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  46.48 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  50 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  49.27 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  48.97 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.22 
 
 		 516 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.79 
 
 		 516 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  34.88 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  50.96 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  45.65 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  50.96 
 
 		 206 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  56.92 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  53.4 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  53.4 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  36.2 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  42.24 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.23 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  52.58 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.68 
 
 		 517 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  46.01 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  46.26 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  39.21 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  54.07 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  37.9 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  41.15 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.59 
 
 		 527 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.56 
 
 		 528 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  36.57 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40.36 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  48.47 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 511 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.73 
 
 		 511 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  40.64 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  39.29 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  49.74 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  31.28 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.32 
 
 		 526 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.19 
 
 		 539 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 514 aa  135  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  40 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.17 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.95 
 
 		 488 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  36.53 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  39.27 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  34.26 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  38.39 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  36.44 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.84 
 
 		 534 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  37.84 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  36.92 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>