More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0575 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  664    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  51.01 
 
 		 302 aa  315  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  50.17 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  46.83 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  41.75 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  39.18 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  42.52 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  39.5 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  39.7 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  39.31 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  37.38 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  36.81 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  37.66 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  39.6 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  40.88 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  35.43 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  35.43 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  37.01 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  36.04 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  35.91 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  38.22 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  36.68 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  36.89 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.2 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  37.38 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  35.67 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  35.83 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  30.1 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  36.01 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  35.56 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  33.99 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  33.12 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30.42 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  30.98 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  33.44 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  31.31 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  30.77 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  30.79 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.61 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  29.49 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  32.33 
 
 		 299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  32.33 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  29.94 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  28.71 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  29.34 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.62 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  31.68 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  30.87 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  30.1 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  31.48 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.62 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  29.7 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  34.43 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  32.81 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.63 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  30.45 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  30.42 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  30.42 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  31.38 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  27.2 
 
 		 276 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  28.62 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  28.62 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  30.77 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  26.34 
 
 		 283 aa  89.4  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  27.88 
 
 		 244 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  30.29 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  29.28 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  30.33 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  27.87 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  27.87 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  30.56 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1698  PP-loop domain protein  26.8 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  27.72 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  30.47 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  28.99 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  28.74 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  30.43 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  30.86 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  28.12 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  30 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  28.75 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.75 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  27 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  28.85 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  29.48 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  30.5 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  29.48 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.51 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  30.26 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.74 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  27.06 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  27.64 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.33 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>