239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0389 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1038    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  50.09 
 
 
557 aa  524  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  41.91 
 
 
496 aa  359  6e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  28.75 
 
 
611 aa  193  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  32.58 
 
 
524 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  32.07 
 
 
564 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  28.46 
 
 
608 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  32.51 
 
 
559 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  31.21 
 
 
531 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  29.71 
 
 
616 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.63 
 
 
557 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30.73 
 
 
605 aa  184  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  27.66 
 
 
496 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  29.61 
 
 
524 aa  173  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  29.51 
 
 
560 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  28.84 
 
 
523 aa  169  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  28.09 
 
 
561 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  28.46 
 
 
563 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  27.37 
 
 
497 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  27.12 
 
 
497 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  27.07 
 
 
497 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.57 
 
 
524 aa  158  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  27.01 
 
 
493 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.71 
 
 
559 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  26.29 
 
 
523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  27.35 
 
 
492 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.59 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  29.11 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.44 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  30.11 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  38.41 
 
 
581 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  35.23 
 
 
628 aa  113  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  28.31 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  24.18 
 
 
510 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  29.18 
 
 
569 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  25.95 
 
 
360 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  22.14 
 
 
607 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  34.21 
 
 
623 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  33.54 
 
 
579 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  32.53 
 
 
595 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  34.15 
 
 
594 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  22.81 
 
 
550 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  36 
 
 
709 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  37.59 
 
 
617 aa  94.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  21.98 
 
 
600 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  32.56 
 
 
587 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  38.05 
 
 
526 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  33.14 
 
 
709 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  34.84 
 
 
679 aa  91.3  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  23.91 
 
 
574 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.69 
 
 
546 aa  88.6  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30 
 
 
599 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  25.71 
 
 
533 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  26.86 
 
 
495 aa  87.8  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  32.32 
 
 
593 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  24.17 
 
 
651 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25 
 
 
659 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.43 
 
 
575 aa  86.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  24.92 
 
 
670 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.98 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.38 
 
 
674 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  36.2 
 
 
591 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.76 
 
 
591 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  24.63 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  36 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  25.85 
 
 
570 aa  84.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  27.78 
 
 
603 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  28.22 
 
 
601 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  26.63 
 
 
590 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.23 
 
 
714 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.66 
 
 
693 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  24.67 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  23.87 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  27.61 
 
 
1100 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  35.33 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  26.29 
 
 
1046 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  23.13 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.68 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.93 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  26.11 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.02 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  23.96 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.55 
 
 
540 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.61 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  32.83 
 
 
537 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  24.59 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  27.47 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  26.18 
 
 
674 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  24.57 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  30.41 
 
 
664 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0340  ATPase-like protein  24.86 
 
 
359 aa  77  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0340  protein of unknown function DUF87  26.96 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0311557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  25.87 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  31.9 
 
 
595 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  27.49 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  31.29 
 
 
744 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  25.63 
 
 
662 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0213  hypothetical protein  26.61 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0846575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25.92 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  21.27 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>