More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2592 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  83.41 
 
 		 205 aa  350  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  70.39 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  50.73 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  52.66 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.22 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 203 aa  204  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 201 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.29 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  50.97 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 203 aa  197  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  51.46 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.88 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  48.34 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  48.82 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  47.39 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  47.8 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  56.5 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  187  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0834  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  44.81 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.08 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  44.08 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  45.89 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.85 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  45.89 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  48.56 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>